234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4183 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  56.53 
 
 		 817 aa  739    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  63.04 
 
 		 808 aa  917    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  80.12 
 
 		 837 aa  1292    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  60.61 
 
 		 860 aa  851    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  80.12 
 
 		 837 aa  1292    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  89.08 
 
 		 822 aa  1417    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  80.24 
 
 		 837 aa  1295    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  54.21 
 
 		 787 aa  737    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 824 aa  1608    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.76 
 
 		 791 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  42.93 
 
 		 761 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  40.39 
 
 		 786 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.43 
 
 		 780 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  43.28 
 
 		 812 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  42.13 
 
 		 785 aa  422  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  41.3 
 
 		 764 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  39.46 
 
 		 771 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  41.45 
 
 		 764 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  40.11 
 
 		 778 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  38.24 
 
 		 707 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  40.14 
 
 		 640 aa  311  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  40.64 
 
 		 598 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.19 
 
 		 832 aa  303  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  41.17 
 
 		 582 aa  296  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.56 
 
 		 622 aa  295  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.59 
 
 		 571 aa  288  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.33 
 
 		 924 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.41 
 
 		 887 aa  238  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.78 
 
 		 938 aa  238  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  32.08 
 
 		 596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  27.87 
 
 		 936 aa  233  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.11 
 
 		 905 aa  232  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.83 
 
 		 894 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.74 
 
 		 894 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.97 
 
 		 934 aa  224  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  27.95 
 
 		 935 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  26.49 
 
 		 899 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  25.82 
 
 		 931 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  26.58 
 
 		 902 aa  219  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  27.13 
 
 		 968 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  27.24 
 
 		 968 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.2 
 
 		 864 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  26.51 
 
 		 941 aa  214  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  26.05 
 
 		 934 aa  213  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  25.93 
 
 		 934 aa  211  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  27.03 
 
 		 890 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  26.62 
 
 		 914 aa  210  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  26.97 
 
 		 943 aa  210  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.78 
 
 		 900 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  27.03 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  27.03 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  27.03 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  27.03 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  27.1 
 
 		 861 aa  208  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  25.37 
 
 		 856 aa  208  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  27.08 
 
 		 930 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  27.63 
 
 		 937 aa  207  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  26.6 
 
 		 861 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  26.53 
 
 		 852 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  26.53 
 
 		 899 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  27.43 
 
 		 936 aa  206  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  26.97 
 
 		 930 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  26.04 
 
 		 890 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  26.04 
 
 		 890 aa  204  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  26.04 
 
 		 890 aa  204  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  28.69 
 
 		 936 aa  204  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  26.04 
 
 		 890 aa  203  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  26.04 
 
 		 890 aa  203  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.62 
 
 		 894 aa  203  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  26.04 
 
 		 890 aa  203  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.04 
 
 		 890 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  28 
 
 		 1029 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  26.04 
 
 		 890 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  26.56 
 
 		 930 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  26.18 
 
 		 890 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  24.57 
 
 		 900 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  26.73 
 
 		 949 aa  202  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  26.1 
 
 		 912 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  25.74 
 
 		 900 aa  201  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  24.29 
 
 		 898 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  26.11 
 
 		 900 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 		 889 aa  200  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  25.95 
 
 		 900 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  26.55 
 
 		 891 aa  200  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.63 
 
 		 930 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  25.99 
 
 		 900 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  24.63 
 
 		 874 aa  198  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.48 
 
 		 930 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  25.98 
 
 		 862 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  25.89 
 
 		 862 aa  197  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 		 930 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3046  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.57 
 
 		 833 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  26.3 
 
 		 899 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  26.23 
 
 		 933 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  27.28 
 
 		 928 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  26.32 
 
 		 869 aa  195  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  27.28 
 
 		 928 aa  195  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  25.48 
 
 		 895 aa  194  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  26.8 
 
 		 928 aa  194  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  26.35 
 
 		 900 aa  194  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>