232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1610 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  53.86 
 
 		 787 aa  670    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  57.93 
 
 		 860 aa  815    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  55.94 
 
 		 837 aa  832    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  55.94 
 
 		 837 aa  832    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  57 
 
 		 822 aa  831    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  56.67 
 
 		 808 aa  751    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 817 aa  1560    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  55.94 
 
 		 837 aa  832    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  55.99 
 
 		 824 aa  823    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.66 
 
 		 791 aa  462  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  46.86 
 
 		 761 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  45.86 
 
 		 780 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  42.35 
 
 		 786 aa  445  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  46.69 
 
 		 812 aa  436  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  44.05 
 
 		 764 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  44.62 
 
 		 771 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  42.38 
 
 		 785 aa  392  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  42.46 
 
 		 764 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  40 
 
 		 707 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  40.57 
 
 		 778 aa  352  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  42.6 
 
 		 640 aa  345  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.33 
 
 		 622 aa  330  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  42.07 
 
 		 598 aa  316  9e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  41.89 
 
 		 582 aa  301  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.09 
 
 		 832 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.1 
 
 		 571 aa  287  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  32.34 
 
 		 596 aa  259  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  29.22 
 
 		 935 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  27.47 
 
 		 899 aa  226  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.81 
 
 		 894 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.56 
 
 		 894 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.96 
 
 		 887 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.57 
 
 		 893 aa  221  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  25.79 
 
 		 900 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  27.16 
 
 		 899 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  26.3 
 
 		 902 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  27.71 
 
 		 912 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.34 
 
 		 864 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  29.86 
 
 		 899 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  26.26 
 
 		 857 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.14 
 
 		 905 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  27.22 
 
 		 856 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.13 
 
 		 894 aa  214  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  26.42 
 
 		 900 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 		 900 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 		 900 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  27.02 
 
 		 900 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  26.64 
 
 		 898 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  25.56 
 
 		 856 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.18 
 
 		 897 aa  207  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  25.65 
 
 		 936 aa  206  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  26.04 
 
 		 861 aa  205  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.81 
 
 		 900 aa  205  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  26.83 
 
 		 930 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  26.83 
 
 		 930 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.49 
 
 		 924 aa  204  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  25.79 
 
 		 900 aa  203  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  25.34 
 
 		 898 aa  202  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.36 
 
 		 934 aa  202  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  26.67 
 
 		 899 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  26.36 
 
 		 898 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  27.98 
 
 		 938 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  27.3 
 
 		 943 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  27.17 
 
 		 857 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  25.83 
 
 		 892 aa  198  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  25.66 
 
 		 881 aa  198  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  26.64 
 
 		 930 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  24.97 
 
 		 861 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  26.5 
 
 		 906 aa  197  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  26.52 
 
 		 968 aa  197  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  27.45 
 
 		 895 aa  197  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  26.25 
 
 		 859 aa  196  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  28.08 
 
 		 858 aa  195  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  26.09 
 
 		 890 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  29.31 
 
 		 875 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  25.42 
 
 		 874 aa  194  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  26.09 
 
 		 890 aa  194  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  27.46 
 
 		 885 aa  194  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  26.09 
 
 		 890 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  26.13 
 
 		 883 aa  193  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  26.09 
 
 		 890 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  25.49 
 
 		 861 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  25.09 
 
 		 861 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  25.49 
 
 		 860 aa  193  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  25.48 
 
 		 861 aa  193  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01140  PII uridylyl-transferase  28.98 
 
 		 838 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  25.48 
 
 		 890 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  25.48 
 
 		 890 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  26.4 
 
 		 852 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  25.48 
 
 		 890 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  25.5 
 
 		 891 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  25.98 
 
 		 890 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  25.48 
 
 		 890 aa  191  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  25.48 
 
 		 890 aa  191  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  25.87 
 
 		 931 aa  191  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 		 930 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  25.7 
 
 		 890 aa  191  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0441  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  24.14 
 
 		 913 aa  191  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.48 
 
 		 890 aa  191  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  22.59 
 
 		 878 aa  190  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>