242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1787 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  61.7 
 
 		 780 aa  798    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  55.37 
 
 		 771 aa  641    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  100 
 
 		 761 aa  1446    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  49.8 
 
 		 791 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  53.87 
 
 		 785 aa  567  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  49.05 
 
 		 786 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  53.23 
 
 		 812 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  50.62 
 
 		 764 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  44.02 
 
 		 837 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  44.02 
 
 		 837 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  44.32 
 
 		 837 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  47.32 
 
 		 787 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  43.24 
 
 		 824 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  48.84 
 
 		 764 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  45.69 
 
 		 808 aa  501  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  43.64 
 
 		 822 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  46.86 
 
 		 707 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  50 
 
 		 778 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  46.86 
 
 		 817 aa  470  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  42.65 
 
 		 860 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  49.01 
 
 		 832 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  47.98 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  47.7 
 
 		 640 aa  395  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.83 
 
 		 622 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  48.02 
 
 		 582 aa  361  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.69 
 
 		 571 aa  343  9e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  34.11 
 
 		 596 aa  301  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  27.05 
 
 		 902 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.28 
 
 		 894 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.03 
 
 		 894 aa  262  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  28.15 
 
 		 936 aa  258  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 		 898 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 		 927 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.83 
 
 		 864 aa  251  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  28.73 
 
 		 933 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  27.65 
 
 		 933 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  27.32 
 
 		 968 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  26.19 
 
 		 899 aa  248  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  27.07 
 
 		 968 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  25.81 
 
 		 906 aa  247  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  25.6 
 
 		 900 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  27.96 
 
 		 943 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  25.6 
 
 		 900 aa  244  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.3 
 
 		 930 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  26.51 
 
 		 883 aa  243  9e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  27.55 
 
 		 931 aa  243  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  25.48 
 
 		 900 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.3 
 
 		 930 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  26.96 
 
 		 932 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  27.18 
 
 		 931 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  26.47 
 
 		 898 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  28 
 
 		 969 aa  240  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  25.6 
 
 		 900 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  27.26 
 
 		 914 aa  239  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  26.35 
 
 		 899 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 		 930 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.43 
 
 		 900 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  26.08 
 
 		 874 aa  239  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.4 
 
 		 924 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.26 
 
 		 887 aa  238  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  27.25 
 
 		 930 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.06 
 
 		 905 aa  237  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  26.86 
 
 		 895 aa  236  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 		 889 aa  235  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  27.31 
 
 		 931 aa  234  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  26.46 
 
 		 931 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  26.66 
 
 		 930 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  29.16 
 
 		 877 aa  232  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  27.1 
 
 		 925 aa  232  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  26.66 
 
 		 930 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 		 906 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  26.5 
 
 		 900 aa  231  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  22.88 
 
 		 869 aa  230  8e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  28.13 
 
 		 899 aa  228  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  28.54 
 
 		 937 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  28.45 
 
 		 941 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  25.36 
 
 		 900 aa  225  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  26.01 
 
 		 874 aa  225  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  26.23 
 
 		 898 aa  224  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  28.24 
 
 		 935 aa  223  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  25.4 
 
 		 856 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  31.25 
 
 		 875 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  28.22 
 
 		 935 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  26.42 
 
 		 857 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  26.12 
 
 		 852 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  27.01 
 
 		 893 aa  219  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.37 
 
 		 893 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  27.93 
 
 		 934 aa  218  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  28.12 
 
 		 869 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1918  PII uridylyl-transferase  28.28 
 
 		 884 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151624 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  26.35 
 
 		 936 aa  213  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  26.72 
 
 		 881 aa  213  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  29.72 
 
 		 890 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  27.71 
 
 		 862 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  29.54 
 
 		 890 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  27.88 
 
 		 862 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  29.54 
 
 		 890 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  29.54 
 
 		 890 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  29.54 
 
 		 890 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  25.25 
 
 		 851 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>