257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1564 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 771 aa  1463    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  55.37 
 
 		 761 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  53.61 
 
 		 780 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  49.15 
 
 		 786 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  46.74 
 
 		 791 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  48.23 
 
 		 812 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  45.58 
 
 		 764 aa  472  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  42.04 
 
 		 808 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  46.79 
 
 		 785 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  40.49 
 
 		 837 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  40.18 
 
 		 824 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  40.49 
 
 		 837 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  40.6 
 
 		 837 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  45.77 
 
 		 787 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  44.62 
 
 		 707 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  40.97 
 
 		 822 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  45.03 
 
 		 764 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  45.53 
 
 		 817 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  44.69 
 
 		 778 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  41.1 
 
 		 860 aa  405  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.83 
 
 		 832 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  45.36 
 
 		 640 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  44.33 
 
 		 598 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.58 
 
 		 622 aa  350  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  45.23 
 
 		 582 aa  333  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.39 
 
 		 571 aa  302  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  32.3 
 
 		 596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.96 
 
 		 894 aa  263  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.73 
 
 		 894 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  27.83 
 
 		 902 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  28 
 
 		 899 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.33 
 
 		 905 aa  251  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  26.95 
 
 		 898 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.48 
 
 		 864 aa  248  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  28.35 
 
 		 936 aa  241  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.21 
 
 		 887 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  27.87 
 
 		 968 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  27.63 
 
 		 968 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  28.7 
 
 		 931 aa  232  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  26.81 
 
 		 931 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  28.89 
 
 		 949 aa  231  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.28 
 
 		 924 aa  231  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 		 927 aa  230  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  28.77 
 
 		 852 aa  229  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  29.24 
 
 		 941 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  28.13 
 
 		 932 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  28.62 
 
 		 933 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.92 
 
 		 930 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  29.12 
 
 		 969 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 		 930 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.15 
 
 		 930 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  27.29 
 
 		 943 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  27.35 
 
 		 931 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  27.3 
 
 		 914 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  27.76 
 
 		 941 aa  225  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  29.2 
 
 		 912 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  28.34 
 
 		 933 aa  224  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  27.92 
 
 		 931 aa  222  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.65 
 
 		 934 aa  220  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  26.91 
 
 		 900 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  28.33 
 
 		 953 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.71 
 
 		 900 aa  220  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  26.67 
 
 		 900 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  26.73 
 
 		 900 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  26.67 
 
 		 900 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  26.33 
 
 		 934 aa  218  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  27.84 
 
 		 925 aa  217  8e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  26.21 
 
 		 934 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 		 906 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  28.47 
 
 		 884 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  28 
 
 		 936 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  26.24 
 
 		 856 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  27.75 
 
 		 930 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2294  PII uridylyl-transferase  28.36 
 
 		 884 aa  213  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0510748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  25.65 
 
 		 906 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  27.1 
 
 		 899 aa  212  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  25.39 
 
 		 900 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  29.11 
 
 		 850 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  28.55 
 
 		 895 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  29.4 
 
 		 935 aa  210  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  27.48 
 
 		 936 aa  210  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  27.59 
 
 		 928 aa  209  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  27.74 
 
 		 928 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  27.59 
 
 		 928 aa  209  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  26.64 
 
 		 899 aa  208  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  26.04 
 
 		 900 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  26.22 
 
 		 900 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  25.77 
 
 		 898 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  26.79 
 
 		 930 aa  205  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  26.79 
 
 		 930 aa  205  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  27.92 
 
 		 935 aa  204  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  28.37 
 
 		 885 aa  204  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 1029 aa  204  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1759  PII uridylyl-transferase  28.09 
 
 		 875 aa  203  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.308233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  26.01 
 
 		 900 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  27.33 
 
 		 861 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  30.76 
 
 		 875 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  31.94 
 
 		 938 aa  201  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  26.07 
 
 		 899 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  26.08 
 
 		 893 aa  198  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>