229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3425 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  60.95 
 
 		 761 aa  759    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 780 aa  1483    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  52.84 
 
 		 771 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  52.6 
 
 		 764 aa  545  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  47.28 
 
 		 786 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  48.62 
 
 		 791 aa  514  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  50.82 
 
 		 764 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  50.28 
 
 		 812 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  48.54 
 
 		 778 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  43.36 
 
 		 837 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  43.36 
 
 		 837 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  45.79 
 
 		 787 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  43.44 
 
 		 808 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  48.51 
 
 		 785 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  43.52 
 
 		 837 aa  466  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  43.98 
 
 		 822 aa  459  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  41.82 
 
 		 824 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  43.47 
 
 		 707 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  45.65 
 
 		 817 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  42.35 
 
 		 860 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  48.55 
 
 		 640 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.5 
 
 		 832 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.01 
 
 		 622 aa  362  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  48.71 
 
 		 598 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  49.38 
 
 		 582 aa  345  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.48 
 
 		 571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.83 
 
 		 894 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.35 
 
 		 894 aa  278  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  27.04 
 
 		 899 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  33.09 
 
 		 596 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  26.65 
 
 		 898 aa  252  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.64 
 
 		 900 aa  243  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.01 
 
 		 905 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.45 
 
 		 887 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  27.7 
 
 		 943 aa  240  6.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 931 aa  236  9e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  27.17 
 
 		 930 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  27.97 
 
 		 930 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  27.17 
 
 		 930 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  27.5 
 
 		 914 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.61 
 
 		 930 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.61 
 
 		 930 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.29 
 
 		 864 aa  233  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 		 928 aa  233  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 		 930 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 		 872 aa  230  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  27.49 
 
 		 928 aa  230  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.41 
 
 		 938 aa  229  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  27.49 
 
 		 928 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  27.86 
 
 		 936 aa  228  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 		 927 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  28 
 
 		 931 aa  226  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  26.23 
 
 		 900 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  27.28 
 
 		 912 aa  225  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  25.82 
 
 		 906 aa  224  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  27.26 
 
 		 933 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  26.74 
 
 		 933 aa  222  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  26.63 
 
 		 900 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  27.16 
 
 		 932 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  26.63 
 
 		 900 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  27.32 
 
 		 925 aa  220  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  27.82 
 
 		 899 aa  220  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  28.49 
 
 		 1029 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  26.27 
 
 		 893 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  25.98 
 
 		 900 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  25.87 
 
 		 900 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  27.78 
 
 		 935 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  28.47 
 
 		 912 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  27.28 
 
 		 968 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  28.66 
 
 		 935 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.39 
 
 		 934 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  26.78 
 
 		 936 aa  215  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  27.91 
 
 		 968 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  26.79 
 
 		 931 aa  214  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  26.15 
 
 		 874 aa  212  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  26.75 
 
 		 881 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  26.58 
 
 		 895 aa  211  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  26.39 
 
 		 941 aa  211  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.12 
 
 		 924 aa  211  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  28.62 
 
 		 902 aa  210  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  26.27 
 
 		 899 aa  209  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  26.67 
 
 		 898 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  26.78 
 
 		 931 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  23.71 
 
 		 878 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  25.64 
 
 		 900 aa  203  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  28.16 
 
 		 941 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  27.09 
 
 		 949 aa  203  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  25.93 
 
 		 900 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  25.15 
 
 		 851 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  25.51 
 
 		 900 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  26.56 
 
 		 890 aa  200  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  26.28 
 
 		 861 aa  200  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  25.98 
 
 		 861 aa  200  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  26.46 
 
 		 857 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  26.55 
 
 		 898 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  26.16 
 
 		 861 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0829  PII uridylyl-transferase  24.79 
 
 		 861 aa  198  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2904  PII uridylyl-transferase  26.03 
 
 		 861 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0760318  normal  0.279173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  25.6 
 
 		 861 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  26.85 
 
 		 904 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>