238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1958 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  54.66 
 
 		 787 aa  733    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  62.22 
 
 		 860 aa  875    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  57.18 
 
 		 817 aa  757    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 837 aa  1644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  65.63 
 
 		 808 aa  939    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 837 aa  1644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  80.41 
 
 		 822 aa  1277    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  80.12 
 
 		 824 aa  1304    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  99.64 
 
 		 837 aa  1636    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.27 
 
 		 791 aa  458  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  44.15 
 
 		 761 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.36 
 
 		 780 aa  445  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  43.46 
 
 		 764 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  40.52 
 
 		 786 aa  439  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  43.3 
 
 		 812 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  44.29 
 
 		 785 aa  426  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  42.48 
 
 		 764 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  40.08 
 
 		 771 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  40.69 
 
 		 778 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  38.62 
 
 		 707 aa  361  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  41.92 
 
 		 640 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.83 
 
 		 832 aa  317  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  41.28 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  41.58 
 
 		 582 aa  299  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.66 
 
 		 622 aa  296  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.47 
 
 		 571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  31.21 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.88 
 
 		 887 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.83 
 
 		 938 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.44 
 
 		 924 aa  231  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  26.15 
 
 		 902 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.28 
 
 		 894 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.62 
 
 		 894 aa  224  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  26.64 
 
 		 899 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.92 
 
 		 905 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  27.12 
 
 		 936 aa  222  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.85 
 
 		 934 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.99 
 
 		 900 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  27.54 
 
 		 936 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  27.22 
 
 		 1029 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  26.23 
 
 		 968 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  26.5 
 
 		 899 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  26.35 
 
 		 968 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 898 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  26.27 
 
 		 943 aa  211  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  25.62 
 
 		 931 aa  211  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  26.22 
 
 		 899 aa  210  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  26.07 
 
 		 890 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  26.19 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  26.19 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  27.22 
 
 		 937 aa  209  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  26.19 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  25.48 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  26.19 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.84 
 
 		 890 aa  208  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  26 
 
 		 941 aa  208  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  26.17 
 
 		 852 aa  208  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  26.07 
 
 		 890 aa  208  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  25.96 
 
 		 890 aa  208  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  25.41 
 
 		 856 aa  207  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  26.55 
 
 		 935 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  25.74 
 
 		 900 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  26.19 
 
 		 861 aa  206  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  26.92 
 
 		 930 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  27.2 
 
 		 861 aa  205  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  25.59 
 
 		 900 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  25.79 
 
 		 934 aa  204  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  26.8 
 
 		 930 aa  204  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  25.59 
 
 		 900 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  27.29 
 
 		 989 aa  204  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  26.11 
 
 		 914 aa  204  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.16 
 
 		 864 aa  203  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  25.47 
 
 		 900 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  25.8 
 
 		 934 aa  203  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  26.17 
 
 		 912 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  26.35 
 
 		 889 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  25.77 
 
 		 891 aa  202  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  26.81 
 
 		 930 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  26.18 
 
 		 890 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 930 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0441  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  23.66 
 
 		 913 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  26.91 
 
 		 933 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  26.52 
 
 		 893 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.32 
 
 		 930 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.32 
 
 		 930 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  25.61 
 
 		 949 aa  201  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  26.17 
 
 		 890 aa  201  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  26.17 
 
 		 890 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  26.17 
 
 		 890 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  25.48 
 
 		 898 aa  200  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  27.72 
 
 		 935 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  26.17 
 
 		 890 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  26.85 
 
 		 928 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.06 
 
 		 894 aa  198  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0395  protein-P-II uridylyltransferase  23.54 
 
 		 915 aa  196  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  26.33 
 
 		 933 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  26.85 
 
 		 928 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  26.85 
 
 		 928 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
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NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  28.65 
 
 		 850 aa  196  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
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NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  24.32 
 
 		 900 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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