242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5932 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  55.04 
 
 		 837 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  54.11 
 
 		 817 aa  661    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  55.04 
 
 		 837 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  52.49 
 
 		 808 aa  702    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  55.6 
 
 		 822 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 787 aa  1497    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  55.04 
 
 		 837 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  54.53 
 
 		 860 aa  722    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  54.59 
 
 		 824 aa  796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.84 
 
 		 791 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  47.15 
 
 		 761 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  46.4 
 
 		 785 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  45.14 
 
 		 780 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  46.67 
 
 		 812 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  43.16 
 
 		 786 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  44.39 
 
 		 764 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  45.26 
 
 		 771 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  42.43 
 
 		 778 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  43.64 
 
 		 764 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  40.98 
 
 		 707 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  42.63 
 
 		 640 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  45.76 
 
 		 832 aa  336  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.55 
 
 		 622 aa  326  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  42.96 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  43.8 
 
 		 582 aa  314  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.16 
 
 		 571 aa  294  5e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  35.89 
 
 		 596 aa  277  6e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.58 
 
 		 894 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.2 
 
 		 894 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.89 
 
 		 887 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  27.23 
 
 		 902 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  27.52 
 
 		 943 aa  231  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.28 
 
 		 924 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  25.93 
 
 		 899 aa  229  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  27.68 
 
 		 914 aa  226  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  24.91 
 
 		 898 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  24.65 
 
 		 906 aa  219  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  27.6 
 
 		 936 aa  219  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  29.04 
 
 		 936 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.83 
 
 		 938 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  29.31 
 
 		 927 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.99 
 
 		 905 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.66 
 
 		 864 aa  214  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  26.08 
 
 		 931 aa  213  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  28.21 
 
 		 1029 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  26.83 
 
 		 934 aa  209  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  25.33 
 
 		 900 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  26.83 
 
 		 934 aa  209  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.66 
 
 		 916 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  27.18 
 
 		 934 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  27.37 
 
 		 928 aa  207  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  27.37 
 
 		 928 aa  207  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  27.35 
 
 		 928 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.42 
 
 		 930 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 		 872 aa  205  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  28.54 
 
 		 930 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  28.67 
 
 		 912 aa  204  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  25.71 
 
 		 900 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.3 
 
 		 930 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  27.46 
 
 		 931 aa  204  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  25.59 
 
 		 900 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  28.41 
 
 		 930 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  28.71 
 
 		 937 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  28.41 
 
 		 930 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  25.12 
 
 		 899 aa  202  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  26.39 
 
 		 933 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  26.62 
 
 		 931 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  25.06 
 
 		 861 aa  200  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  25.15 
 
 		 900 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  28.8 
 
 		 969 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  22.35 
 
 		 869 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  26.67 
 
 		 936 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  27 
 
 		 930 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  28.09 
 
 		 935 aa  198  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  27 
 
 		 949 aa  198  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 		 935 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  26.67 
 
 		 861 aa  197  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  26.44 
 
 		 852 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  29.22 
 
 		 850 aa  195  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  24.81 
 
 		 899 aa  196  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  26.9 
 
 		 968 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  26.57 
 
 		 968 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  24.91 
 
 		 857 aa  194  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  26.81 
 
 		 941 aa  193  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  24.57 
 
 		 898 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  25.79 
 
 		 931 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  26.04 
 
 		 933 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 		 889 aa  192  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  24.94 
 
 		 900 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  29.43 
 
 		 895 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  28.08 
 
 		 941 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  26.79 
 
 		 900 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  26.75 
 
 		 887 aa  191  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  27.05 
 
 		 900 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  25.56 
 
 		 862 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  25.34 
 
 		 862 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.5 
 
 		 900 aa  190  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  25.71 
 
 		 856 aa  189  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  23.51 
 
 		 861 aa  188  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  27.76 
 
 		 953 aa  189  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>