233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2080 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  54 
 
 		 787 aa  715    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  62.22 
 
 		 837 aa  932    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  100 
 
 		 860 aa  1677    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  57.94 
 
 		 808 aa  801    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  58.76 
 
 		 817 aa  805    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  62.22 
 
 		 837 aa  932    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  62.16 
 
 		 822 aa  920    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  62.1 
 
 		 837 aa  929    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  60.61 
 
 		 824 aa  916    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  43.86 
 
 		 812 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  42.86 
 
 		 761 aa  436  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  41.9 
 
 		 785 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  40.28 
 
 		 786 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.22 
 
 		 780 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.26 
 
 		 791 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  42.9 
 
 		 764 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  41.8 
 
 		 764 aa  389  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  40.4 
 
 		 771 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  39.97 
 
 		 778 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  35.58 
 
 		 707 aa  345  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  42.09 
 
 		 640 aa  335  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  41.23 
 
 		 598 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  42.72 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.54 
 
 		 622 aa  301  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.27 
 
 		 571 aa  301  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.74 
 
 		 832 aa  283  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  33.52 
 
 		 596 aa  262  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.49 
 
 		 938 aa  226  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  25.24 
 
 		 902 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.01 
 
 		 894 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.94 
 
 		 924 aa  221  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.52 
 
 		 887 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.87 
 
 		 894 aa  220  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  25.24 
 
 		 899 aa  219  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  24.57 
 
 		 900 aa  218  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  26.95 
 
 		 852 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  26.27 
 
 		 943 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  26.36 
 
 		 914 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  28.21 
 
 		 936 aa  210  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.88 
 
 		 934 aa  209  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  25.48 
 
 		 856 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.08 
 
 		 864 aa  207  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  26.96 
 
 		 941 aa  207  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 		 898 aa  207  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  27.49 
 
 		 930 aa  207  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  26.82 
 
 		 861 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  27.37 
 
 		 935 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  27.64 
 
 		 1029 aa  205  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  25.9 
 
 		 936 aa  205  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  27.26 
 
 		 912 aa  204  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0556  metal dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 		 899 aa  204  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258602 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  22.56 
 
 		 869 aa  203  9e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  27.08 
 
 		 968 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  26.03 
 
 		 931 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.62 
 
 		 905 aa  201  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  26.47 
 
 		 949 aa  200  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  25.87 
 
 		 899 aa  200  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  26.22 
 
 		 934 aa  200  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  26.63 
 
 		 934 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 		 897 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  26.89 
 
 		 899 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.82 
 
 		 900 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  27.25 
 
 		 930 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  27.25 
 
 		 930 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  26.07 
 
 		 862 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.9 
 
 		 862 aa  197  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  27.9 
 
 		 862 aa  197  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.72 
 
 		 893 aa  197  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  26.07 
 
 		 862 aa  197  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  25.55 
 
 		 933 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  26.35 
 
 		 893 aa  196  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  25.74 
 
 		 899 aa  196  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.42 
 
 		 930 aa  195  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.31 
 
 		 930 aa  194  9e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  27.64 
 
 		 928 aa  193  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  27.59 
 
 		 858 aa  193  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  27.1 
 
 		 937 aa  193  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  23.09 
 
 		 906 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  29.97 
 
 		 861 aa  192  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  26.67 
 
 		 850 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 930 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  29.4 
 
 		 875 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  26.28 
 
 		 857 aa  190  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2942  PII uridylyl-transferase  25.72 
 
 		 868 aa  190  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2422  PII uridylyl-transferase  26.44 
 
 		 863 aa  190  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  26.97 
 
 		 895 aa  189  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  25.66 
 
 		 931 aa  189  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  26.68 
 
 		 928 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  26.76 
 
 		 890 aa  189  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  26.56 
 
 		 928 aa  189  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  27.3 
 
 		 885 aa  188  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  24.62 
 
 		 900 aa  188  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  26.82 
 
 		 931 aa  187  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  25.89 
 
 		 874 aa  187  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  25.03 
 
 		 933 aa  187  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  25.12 
 
 		 892 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  24.79 
 
 		 932 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3046  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.86 
 
 		 833 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  24.37 
 
 		 900 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  27.82 
 
 		 968 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>