226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0910 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  40.85 
 
 		 878 aa  716    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  41.01 
 
 		 859 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  40.25 
 
 		 883 aa  667    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3229  protein-P-II uridylyltransferase  41.17 
 
 		 857 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  40.34 
 
 		 874 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  39.04 
 
 		 874 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3942  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  56.78 
 
 		 868 aa  1017    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2877  protein-P-II uridylyltransferase  69.92 
 
 		 874 aa  1255    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.521501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0910  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 882 aa  1828    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0445386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  40.14 
 
 		 857 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  40.95 
 
 		 881 aa  676    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3746  (protein-PII) uridylyltransferase  55.92 
 
 		 867 aa  1009    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  40.68 
 
 		 859 aa  634  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  39.91 
 
 		 892 aa  634  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  39.68 
 
 		 861 aa  632  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3004  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.67 
 
 		 869 aa  630  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  38.76 
 
 		 890 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.73 
 
 		 890 aa  626  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  39.77 
 
 		 856 aa  628  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  38.84 
 
 		 904 aa  626  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  37.73 
 
 		 890 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  37.73 
 
 		 890 aa  624  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  37.73 
 
 		 890 aa  624  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  37.73 
 
 		 890 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  37.61 
 
 		 890 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  37.73 
 
 		 890 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  37.93 
 
 		 890 aa  624  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  40.26 
 
 		 861 aa  621  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  37.61 
 
 		 890 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1247  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.1 
 
 		 870 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  39.79 
 
 		 861 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  38.17 
 
 		 890 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  39.79 
 
 		 861 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  37.92 
 
 		 891 aa  617  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  38.45 
 
 		 903 aa  618  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  38.05 
 
 		 890 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  38.05 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  39.67 
 
 		 861 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  38.05 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  38.05 
 
 		 890 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  40.11 
 
 		 857 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  39.46 
 
 		 860 aa  611  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1479  PII uridylyl-transferase  39.62 
 
 		 861 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2904  PII uridylyl-transferase  39.74 
 
 		 861 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0760318  normal  0.279173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1448  PII uridylyl-transferase  39.62 
 
 		 861 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1443  PII uridylyl-transferase  39.62 
 
 		 861 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  37.59 
 
 		 893 aa  608  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  39.65 
 
 		 851 aa  602  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  38.88 
 
 		 893 aa  598  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  38.88 
 
 		 912 aa  598  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  38.88 
 
 		 893 aa  598  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  36.24 
 
 		 899 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  36.32 
 
 		 900 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  36.32 
 
 		 900 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  35.54 
 
 		 898 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  35.31 
 
 		 899 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.92 
 
 		 893 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  37.24 
 
 		 889 aa  535  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  35.12 
 
 		 900 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  35.05 
 
 		 900 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0829  PII uridylyl-transferase  34.94 
 
 		 861 aa  526  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.11 
 
 		 894 aa  527  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  34.74 
 
 		 900 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  34.74 
 
 		 900 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  34.74 
 
 		 900 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  35.35 
 
 		 899 aa  522  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  34.59 
 
 		 900 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  35.27 
 
 		 881 aa  522  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  34.7 
 
 		 898 aa  512  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  34.91 
 
 		 892 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  34.14 
 
 		 891 aa  502  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  34.64 
 
 		 877 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  34.11 
 
 		 888 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0556  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 		 899 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 		 897 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  32.87 
 
 		 861 aa  476  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  32.87 
 
 		 861 aa  475  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0441  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  31.9 
 
 		 913 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0395  protein-P-II uridylyltransferase  32.13 
 
 		 915 aa  452  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  34.52 
 
 		 862 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  31.5 
 
 		 856 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.63 
 
 		 863 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.52 
 
 		 862 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  33.49 
 
 		 852 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 850 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  33.61 
 
 		 858 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  33.57 
 
 		 857 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  33.77 
 
 		 875 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  32.77 
 
 		 869 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  32.91 
 
 		 858 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01140  PII uridylyl-transferase  33.81 
 
 		 838 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  32.75 
 
 		 859 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  33.25 
 
 		 858 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  33.02 
 
 		 862 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  32.87 
 
 		 858 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  33.25 
 
 		 858 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  32.87 
 
 		 858 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1453  PII uridylyl-transferase  32.9 
 
 		 865 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 		 858 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  33.25 
 
 		 858 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>