224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3229 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3942  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.47 
 
 		 868 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2877  protein-P-II uridylyltransferase  40.14 
 
 		 874 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.521501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0910  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.52 
 
 		 882 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0445386  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3746  (protein-PII) uridylyltransferase  42.12 
 
 		 867 aa  688    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3229  protein-P-II uridylyltransferase  100 
 
 		 857 aa  1778    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  34.2 
 
 		 878 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  34.24 
 
 		 857 aa  529  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  34.91 
 
 		 890 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  35.98 
 
 		 857 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  35.85 
 
 		 859 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  34.56 
 
 		 893 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  34.49 
 
 		 874 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  34.96 
 
 		 856 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  34.58 
 
 		 904 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  34.53 
 
 		 874 aa  515  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  34.04 
 
 		 861 aa  514  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  34.42 
 
 		 881 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  34.2 
 
 		 883 aa  512  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  34.11 
 
 		 903 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  34.21 
 
 		 859 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  34.96 
 
 		 851 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  34.26 
 
 		 892 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  34 
 
 		 890 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34 
 
 		 890 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  33.8 
 
 		 891 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2904  PII uridylyl-transferase  36.06 
 
 		 861 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0760318  normal  0.279173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  36.06 
 
 		 860 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  33.88 
 
 		 890 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  34 
 
 		 890 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  33.88 
 
 		 890 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  34 
 
 		 890 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  33.88 
 
 		 890 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  36.37 
 
 		 861 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  34.04 
 
 		 890 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1479  PII uridylyl-transferase  36.06 
 
 		 861 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  33.76 
 
 		 890 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1448  PII uridylyl-transferase  36.06 
 
 		 861 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1847  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  35.69 
 
 		 861 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1443  PII uridylyl-transferase  35.94 
 
 		 861 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322557  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  35.56 
 
 		 861 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  35.88 
 
 		 861 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 890 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  33.74 
 
 		 893 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 890 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 890 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  33.74 
 
 		 912 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 890 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  33.45 
 
 		 890 aa  486  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  33.74 
 
 		 893 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1247  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.81 
 
 		 870 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  34.07 
 
 		 899 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  32.28 
 
 		 900 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.06 
 
 		 894 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  32.05 
 
 		 900 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  32.17 
 
 		 900 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  32.05 
 
 		 900 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.42 
 
 		 893 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3004  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.06 
 
 		 869 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  32.29 
 
 		 899 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  32.32 
 
 		 900 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  32.2 
 
 		 900 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  31.35 
 
 		 898 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  30.93 
 
 		 900 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  32.07 
 
 		 900 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  32.84 
 
 		 881 aa  435  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 889 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  31.8 
 
 		 898 aa  429  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  30.81 
 
 		 891 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  31.35 
 
 		 892 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  31.15 
 
 		 899 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  31.12 
 
 		 877 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 		 897 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0829  PII uridylyl-transferase  30.6 
 
 		 861 aa  402  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  29.95 
 
 		 888 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0556  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 899 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  29.61 
 
 		 852 aa  359  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.21 
 
 		 863 aa  357  5.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  28.5 
 
 		 861 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  28.5 
 
 		 861 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01140  PII uridylyl-transferase  27.57 
 
 		 838 aa  346  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120202  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  29.45 
 
 		 861 aa  343  9e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  29.71 
 
 		 862 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  29.59 
 
 		 862 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
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NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  28.46 
 
 		 869 aa  336  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  28.62 
 
 		 859 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0441  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  27.82 
 
 		 913 aa  334  4e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  28.54 
 
 		 875 aa  333  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  29.22 
 
 		 858 aa  332  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  28.4 
 
 		 857 aa  331  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  29.77 
 
 		 858 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
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NC_007204  Psyc_0395  protein-P-II uridylyltransferase  27.56 
 
 		 915 aa  330  6e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919932 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  29.1 
 
 		 858 aa  330  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  28.72 
 
 		 856 aa  330  6e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  29.1 
 
 		 858 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  29.1 
 
 		 858 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  29.1 
 
 		 858 aa  330  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  29.1 
 
 		 858 aa  330  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  29.1 
 
 		 858 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  28.62 
 
 		 850 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  29.77 
 
 		 858 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
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