More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0318 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1057    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  36.23 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  35.66 
 
 		 432 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  36.76 
 
 		 403 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  35.73 
 
 		 404 aa  230  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  35.34 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.12 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 413 aa  170  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 427 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  31.12 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  30.71 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  31.54 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  30 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  29.82 
 
 		 395 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  29.56 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  30.79 
 
 		 418 aa  143  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  30.87 
 
 		 422 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  28.5 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  27.82 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  29.43 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  29.28 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 400 aa  139  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.76 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  28.07 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  29.46 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  29.19 
 
 		 414 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.51 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  29.12 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  28.07 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  28.5 
 
 		 406 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  29.63 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  30.83 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  29.03 
 
 		 461 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  28.09 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  32.6 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  32.6 
 
 		 409 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  27.95 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  32.16 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  29.05 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  26.8 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  27.32 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  25.69 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  27.14 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  26.02 
 
 		 409 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  27.13 
 
 		 418 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  27.61 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  26.91 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  31.16 
 
 		 440 aa  107  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  29.29 
 
 		 411 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  28.54 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  26.15 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  24.74 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  24.74 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 418 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  27.03 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  27.81 
 
 		 418 aa  103  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  28.24 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.59 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  25.64 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  26.01 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 418 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  25.65 
 
 		 418 aa  100  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  26.14 
 
 		 466 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  26.62 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  24.88 
 
 		 395 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 414 aa  97.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  29.14 
 
 		 361 aa  97.8  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 390 aa  97.4  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  28.23 
 
 		 418 aa  97.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  25 
 
 		 401 aa  96.7  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 413 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  25.66 
 
 		 413 aa  96.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 437 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 408 aa  95.9  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  25.46 
 
 		 412 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  26.75 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  25.25 
 
 		 401 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  24.82 
 
 		 418 aa  94  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  24.61 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  25.26 
 
 		 418 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  25.45 
 
 		 400 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 416 aa  91.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 410 aa  91.3  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  26.51 
 
 		 417 aa  90.9  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  24.82 
 
 		 398 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  27.22 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 409 aa  90.1  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  24.12 
 
 		 389 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  26.01 
 
 		 394 aa  89.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>