154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0206 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.5 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  32.38 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  31.1 
 
 		 230 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.5 
 
 		 227 aa  98.6  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  31.78 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  31.31 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.1 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.1 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.48 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.62 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.1 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.31 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.31 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.31 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.31 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  30.62 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  31.41 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  29.41 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.81 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  28.86 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  29.41 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.81 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  28.92 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  28.92 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  28.92 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  32.04 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  30 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  28.92 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.3 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.98 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  28.71 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  31.25 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  27.12 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.65 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0388  cyclic nucleotide-binding protein  21.84 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  27.13 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1924  cyclic nucleotide binding protein, putative  30.32 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0003  putative cyclic nucleotide binding protein  26.49 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000897853  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  30.21 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  24.48 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.68 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  22.84 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  24.06 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.69 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.76 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 229 aa  48.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1784  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.04 
 
 		 240 aa  48.1  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.96 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.1 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3683  cyclic nucleotide binding protein, putative  26.29 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.87 
 
 		 350 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.31 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1785  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.16 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.94 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  23.81 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.83 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.57 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4298  cyclic nucleotide binding protein, putative  23.76 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.42 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>