83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1473 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  100 
 
 		 402 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  98.76 
 
 		 403 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  78.86 
 
 		 404 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  98.01 
 
 		 413 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  99 
 
 		 403 aa  799    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  92.54 
 
 		 380 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  78.61 
 
 		 404 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  78.61 
 
 		 404 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  78.36 
 
 		 404 aa  630  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  78.52 
 
 		 393 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  78.01 
 
 		 384 aa  594  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  66.33 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  41.62 
 
 		 422 aa  315  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  43 
 
 		 408 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  37.21 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  37.21 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  37.21 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  37.21 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  36.98 
 
 		 411 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  36.22 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  36.22 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  36.22 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 421 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  34.88 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  30.83 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  26.6 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  26.63 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  38.95 
 
 		 139 aa  71.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1891  transporter, major facilitator family  32.22 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  32.14 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  32.14 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0914  multidrug translocase MdfA  25.18 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.7 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0904  multidrug translocase MdfA  24.82 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248877  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2800  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00809  multidrug efflux system protein  24.82 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0995  multidrug translocase MdfA  24.82 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.0714029 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00826  hypothetical protein  24.82 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2800  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  45.76 
 
 		 500 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0869  multidrug translocase MdfA  24.46 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  35.05 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  35.05 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  42.37 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  42.37 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  30.21 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.37 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  42.37 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  42.37 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  42.37 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  42.37 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  42.37 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2519  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  36.73 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  47.06 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  47.06 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  20.62 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  47.06 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  47.06 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  24.6 
 
 		 523 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  25.08 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.05 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  30.07 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.59 
 
 		 505 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 467 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 467 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  32.99 
 
 		 500 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  36.21 
 
 		 441 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 434 aa  42.7  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.35 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.88 
 
 		 532 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>