More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1502 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  100 
 
 		 583 aa  1146    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.74 
 
 		 626 aa  303  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37.89 
 
 		 588 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  39.39 
 
 		 626 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.38 
 
 		 614 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.34 
 
 		 600 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.41 
 
 		 613 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.92 
 
 		 619 aa  273  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  40.19 
 
 		 601 aa  273  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.29 
 
 		 587 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.65 
 
 		 605 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  36.81 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.67 
 
 		 593 aa  270  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.95 
 
 		 601 aa  270  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  41.9 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  37.44 
 
 		 618 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.94 
 
 		 587 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.39 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  39.06 
 
 		 601 aa  266  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.78 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  32.79 
 
 		 595 aa  260  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  38.2 
 
 		 571 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.13 
 
 		 595 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  34.89 
 
 		 595 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  33.67 
 
 		 623 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  28.99 
 
 		 598 aa  257  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.47 
 
 		 656 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  38.57 
 
 		 682 aa  256  7e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  35.99 
 
 		 646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.88 
 
 		 595 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  35.99 
 
 		 646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  31.81 
 
 		 653 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  37.47 
 
 		 686 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  38.38 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  36.71 
 
 		 617 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  35.14 
 
 		 674 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  39.63 
 
 		 583 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  38.11 
 
 		 614 aa  253  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  37.03 
 
 		 703 aa  253  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  35.61 
 
 		 609 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  38.81 
 
 		 675 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 604 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  36.6 
 
 		 684 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  37.96 
 
 		 539 aa  251  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.13 
 
 		 583 aa  250  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  38.34 
 
 		 640 aa  249  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  33.67 
 
 		 586 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  36.36 
 
 		 594 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  35.31 
 
 		 640 aa  248  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  40.98 
 
 		 638 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  39.52 
 
 		 574 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  35.2 
 
 		 660 aa  248  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  33.86 
 
 		 586 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  38.66 
 
 		 592 aa  247  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.14 
 
 		 651 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  40.27 
 
 		 694 aa  247  4.9999999999999997e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  37.96 
 
 		 642 aa  246  8e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  36.82 
 
 		 690 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.85 
 
 		 588 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  39.39 
 
 		 588 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.07 
 
 		 582 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.36 
 
 		 652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  36.67 
 
 		 660 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.59 
 
 		 660 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  36.46 
 
 		 660 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  36.18 
 
 		 579 aa  244  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  39.25 
 
 		 663 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  37.56 
 
 		 636 aa  244  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  33.72 
 
 		 584 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  36.21 
 
 		 582 aa  243  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  36.36 
 
 		 639 aa  243  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.76 
 
 		 584 aa  243  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  31.46 
 
 		 605 aa  243  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  40.54 
 
 		 565 aa  243  7.999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  33.19 
 
 		 552 aa  243  7.999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  31.46 
 
 		 605 aa  243  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.9 
 
 		 655 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.28 
 
 		 663 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.59 
 
 		 660 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  38.67 
 
 		 679 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  32.13 
 
 		 585 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.49 
 
 		 604 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  33.89 
 
 		 675 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  31.02 
 
 		 662 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  40.66 
 
 		 664 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  40.91 
 
 		 629 aa  242  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  36.86 
 
 		 583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  38.16 
 
 		 656 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  37.56 
 
 		 582 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  36.86 
 
 		 583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  33.41 
 
 		 660 aa  241  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  37.91 
 
 		 616 aa  240  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.52 
 
 		 598 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  37.22 
 
 		 584 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  37.66 
 
 		 636 aa  239  9e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  37.56 
 
 		 581 aa  239  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  36.8 
 
 		 584 aa  239  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  36.29 
 
 		 582 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  36.29 
 
 		 582 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  36.29 
 
 		 582 aa  239  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>