More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0973 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  100 
 
 		 348 aa  675    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  52.62 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  58.05 
 
 		 209 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  58.05 
 
 		 209 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  52.55 
 
 		 200 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2956  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.3 
 
 		 138 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  39.2 
 
 		 174 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  35.05 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  35.68 
 
 		 439 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.68 
 
 		 448 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10122  hypothetical protein  44.78 
 
 		 144 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0196572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.77 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  36.99 
 
 		 450 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.71 
 
 		 461 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2533  PPOX class putative F420-dependent enzyme  42.75 
 
 		 147 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2174  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.46 
 
 		 155 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1079  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  43.65 
 
 		 142 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.16 
 
 		 446 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  34.65 
 
 		 174 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  33.5 
 
 		 170 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5438  putative F420-dependent enzyme  40.14 
 
 		 150 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.58 
 
 		 442 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  36.57 
 
 		 427 aa  89.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3401  PPOX class putative F420-dependent enzyme  38.92 
 
 		 168 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.9 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.23 
 
 		 526 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1464  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.67 
 
 		 200 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  38.07 
 
 		 431 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.5 
 
 		 170 aa  86.7  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  41.73 
 
 		 152 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00352204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8501  hypothetical protein  42.19 
 
 		 137 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  35.71 
 
 		 167 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  35.86 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.74 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.74 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.74 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.26 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0139978  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.87 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.87 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  40.87 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  30.09 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5743  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.46 
 
 		 164 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  35.05 
 
 		 191 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.08 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19860  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.81 
 
 		 152 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00417181  hitchhiker  0.000280532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.75 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.57 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  33.16 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.06 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30.35 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3177  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.55 
 
 		 253 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.36 
 
 		 584 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.7 
 
 		 166 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.14 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.15 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  31.87 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.35 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.97 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.57 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0315  PPOX class putative F420-dependent enzyme  36.64 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  32.62 
 
 		 196 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.85 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.48 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.64 
 
 		 176 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  33.88 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  28.04 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  26.57 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.79 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  26.51 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.98 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  25.26 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  37.5 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000328973  normal  0.0172812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  28.95 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.5 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  32.06 
 
 		 222 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.98 
 
 		 215 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31 
 
 		 178 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  29.23 
 
 		 192 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  31.16 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  33.5 
 
 		 173 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.75 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  26.05 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.94 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  30.46 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  38.22 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.06 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  26.05 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.05 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  25.94 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1544  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233491  normal  0.110997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.81 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  32.52 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  32.64 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.5 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  28.82 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.41 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  26.98 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.29 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>