More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3643 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
287 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0920178 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65 
 
 
273 aa  341  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.824236  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.6 
 
 
267 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0435882  hitchhiker  0.0000139106 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
267 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.79 
 
 
278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.23 
 
 
262 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 
262 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.06102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.86 
 
 
262 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.83 
 
 
262 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  46.72 
 
 
266 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  45.77 
 
 
268 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
267 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
266 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
290 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
273 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.65 
 
 
267 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365556  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.17 
 
 
267 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0968  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.53 
 
 
255 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
272 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5379  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.9 
 
 
269 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122542  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 
272 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0477123  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
258 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
274 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709092  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
256 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
260 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
269 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
260 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4948  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.617034  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
259 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
259 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
259 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
259 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
258 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  38.81 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
246 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
246 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
253 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
252 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
250 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
248 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
258 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2765  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
260 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
251 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164277  normal  0.032162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
251 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.9 
 
 
246 aa  133  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10933  conserved hypothetical protein  36.02 
 
 
287 aa  132  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  37.36 
 
 
269 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.26 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1082  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.26 
 
 
252 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2110  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 
253 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
259 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.12 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0734  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.64 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.64 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1234  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.02 
 
 
252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1076  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.64 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2279  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.64 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.64 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
257 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.88 
 
 
252 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 
261 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  35.85 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01006  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  35.78 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0876  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.5 
 
 
252 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 
259 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>