More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6333 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 262 aa  510  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.98 
 
 		 262 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.7 
 
 		 267 aa  294  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0435882  hitchhiker  0.0000139106 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.3 
 
 		 267 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.47 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.06102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.65 
 
 		 278 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.51 
 
 		 273 aa  255  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.824236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  49.25 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.83 
 
 		 287 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0920178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 		 266 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.06 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  47.49 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365556  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  46.15 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5379  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.44 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.05 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0968  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.8 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0477123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  43.41 
 
 		 258 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4948  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.617034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  44.02 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.47 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10933  conserved hypothetical protein  39.38 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  38.1 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.78 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.39 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10005  hypothetical protein  38.29 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0299033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  42.15 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  41.44 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.61 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  36.36 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.06 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2110  short chain dehydrogenase  40.7 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2765  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  38.13 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1871  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.8 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 254 aa  141  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.55 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1400  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1817  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06655  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03520)  37.4 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.86 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2853  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.58 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>