More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2291 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  98.6 
 
 		 430 aa  830    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 430 aa  842    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  60.7 
 
 		 433 aa  521  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  48.56 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  47.1 
 
 		 431 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  47.95 
 
 		 432 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  47.13 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  48.14 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  48.14 
 
 		 436 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  48.14 
 
 		 436 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  44.1 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  47.77 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  47.34 
 
 		 429 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  44.67 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  46.4 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  46.63 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  48.22 
 
 		 428 aa  293  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  40.94 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  43.86 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  40.63 
 
 		 432 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  39 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 		 428 aa  252  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 		 427 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 427 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 433 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 433 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 435 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  42.42 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  36.12 
 
 		 427 aa  226  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  35.89 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 440 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  35.97 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  36.36 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 428 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  34 
 
 		 429 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  33.41 
 
 		 428 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  33.41 
 
 		 428 aa  212  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 		 423 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 431 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 429 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  33.65 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  34.04 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  33.65 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 429 aa  202  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  32.71 
 
 		 430 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 427 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 429 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.07 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 453 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.26 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 433 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.26 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.19 
 
 		 427 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 428 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>