256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1114 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  89.88 
 
 
605 aa  1082    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  99.34 
 
 
605 aa  1199    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
605 aa  1207    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  47.73 
 
 
607 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  48.3 
 
 
604 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  46.36 
 
 
630 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  45.05 
 
 
619 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  41.78 
 
 
1464 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.6 
 
 
1703 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  44.07 
 
 
728 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.86 
 
 
1662 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  45.25 
 
 
1642 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.58 
 
 
1673 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  38.01 
 
 
726 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.51 
 
 
1730 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  37.35 
 
 
732 aa  360  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  38.14 
 
 
694 aa  360  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.7 
 
 
1646 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  38.6 
 
 
698 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  45.01 
 
 
1633 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  38.6 
 
 
698 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  38.42 
 
 
698 aa  355  8.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.33 
 
 
1646 aa  355  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.15 
 
 
1650 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  38.95 
 
 
707 aa  352  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.89 
 
 
1715 aa  352  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  36.93 
 
 
731 aa  351  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  35.44 
 
 
732 aa  351  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  44.01 
 
 
1647 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  37.96 
 
 
726 aa  350  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  40.48 
 
 
650 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  37.52 
 
 
694 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  38.82 
 
 
692 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  38.82 
 
 
692 aa  346  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  38.63 
 
 
692 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  38.03 
 
 
717 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  37.61 
 
 
694 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  38.09 
 
 
726 aa  343  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  38.45 
 
 
692 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  37.61 
 
 
694 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  37.43 
 
 
694 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  37.73 
 
 
726 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  37.25 
 
 
694 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  37.43 
 
 
694 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  37.25 
 
 
694 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  37.43 
 
 
694 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  38.45 
 
 
692 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  37.25 
 
 
694 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  37.93 
 
 
656 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  37.43 
 
 
694 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  35.34 
 
 
695 aa  338  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  40.48 
 
 
657 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  39.24 
 
 
663 aa  333  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 
699 aa  332  9e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  39.2 
 
 
646 aa  326  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  38.04 
 
 
669 aa  323  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  40.95 
 
 
650 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  38.67 
 
 
684 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  36.76 
 
 
696 aa  322  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  38.41 
 
 
657 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  37.52 
 
 
692 aa  316  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  37.66 
 
 
736 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  38.79 
 
 
664 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  38.91 
 
 
733 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  36.74 
 
 
735 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  37.55 
 
 
736 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  38.1 
 
 
718 aa  310  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  38.29 
 
 
726 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  37.98 
 
 
692 aa  308  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  35.68 
 
 
724 aa  307  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  37.11 
 
 
730 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  37.09 
 
 
692 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  36.68 
 
 
1342 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  36.63 
 
 
808 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  35.9 
 
 
808 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  36.88 
 
 
724 aa  300  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  36.25 
 
 
808 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  36.25 
 
 
808 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  39.38 
 
 
1410 aa  296  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  39.77 
 
 
691 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  38.17 
 
 
689 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  36.73 
 
 
760 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  36.6 
 
 
796 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  36.73 
 
 
760 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  36.98 
 
 
724 aa  294  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  36.28 
 
 
745 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  36.11 
 
 
801 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  35.93 
 
 
801 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  34.4 
 
 
761 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  37.2 
 
 
610 aa  293  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  37.36 
 
 
682 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  42.96 
 
 
736 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  36.33 
 
 
769 aa  291  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  37.64 
 
 
697 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 
708 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  38.12 
 
 
717 aa  287  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  37.28 
 
 
684 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  37.21 
 
 
689 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  37.07 
 
 
708 aa  283  7.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  37.06 
 
 
743 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>