219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2845 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  53.2 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  51.25 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  52.48 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  50.6 
 
 		 252 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  51.79 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  50.6 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  51.42 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  50.6 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  49.58 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  49.21 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  48.98 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  50.42 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  51.08 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  49.14 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  48.89 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  48.29 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  47.25 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  45.41 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  45.41 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  44.31 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  41.22 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  39.34 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  37.55 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  38.71 
 
 		 245 aa  164  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  45.77 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  44.1 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  41.96 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  43.15 
 
 		 235 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  41.3 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  39.26 
 
 		 242 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  40 
 
 		 238 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  36.64 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  40.77 
 
 		 238 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  40.34 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  39.04 
 
 		 344 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  45.95 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  37.55 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  39.13 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  39.66 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  38.4 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  36.95 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  36.23 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  32.65 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  32.4 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  38.34 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  30.68 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  33.5 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  31.63 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  35.6 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  30.61 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  35.08 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  35.42 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  28.4 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  31.27 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  32.95 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  29.07 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  32.82 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  34.52 
 
 		 239 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  32.7 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  29.57 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  28.69 
 
 		 235 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  30 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  27.41 
 
 		 192 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  34.3 
 
 		 224 aa  92.8  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  36.6 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  29.86 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  27.31 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  30.11 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  28.05 
 
 		 231 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  30.67 
 
 		 220 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  25.1 
 
 		 234 aa  89  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  27.91 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  28.83 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  27.8 
 
 		 235 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  34.59 
 
 		 220 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  32.82 
 
 		 207 aa  85.5  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  32.82 
 
 		 207 aa  85.5  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  32.63 
 
 		 219 aa  85.1  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  32.39 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  30.36 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  30.57 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  30.57 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  29.91 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  30.14 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  32.62 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  26.78 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  26.63 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  32.89 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  32.42 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  27.14 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  29.67 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  29.32 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  29.59 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  25.98 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  28.02 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  28.02 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  28.02 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  27.47 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  28.27 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>