More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1347 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  40.7 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  39.7 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  44.56 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  40.91 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  36.79 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  39.51 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  43.3 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  39.9 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 221 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  34.8 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  40.21 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 227 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  33.16 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>