135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0809 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  100 
 
 		 332 aa  668    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  95.48 
 
 		 332 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  54.57 
 
 		 364 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  50.54 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  54.23 
 
 		 364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  54.23 
 
 		 360 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  54.23 
 
 		 360 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  52.63 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  52.98 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  52.98 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  52.94 
 
 		 364 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  52.98 
 
 		 364 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  52.84 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  50.93 
 
 		 367 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  50.93 
 
 		 367 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  50.62 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  50.31 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  50.62 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  50.62 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  50.62 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  50.62 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  49.45 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  47.77 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  51.59 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  47.71 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  51.32 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  48.3 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  45.03 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  46.78 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  43.71 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  44.84 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  44.22 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  46.84 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  45.67 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  44.58 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  44.41 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  44.52 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 		 305 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  43.05 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  42.09 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  37.71 
 
 		 294 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  33.7 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  31.77 
 
 		 561 aa  99  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.96 
 
 		 286 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  28.38 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  31.94 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  30.05 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  30.05 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  23.16 
 
 		 688 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  26.5 
 
 		 681 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  26.5 
 
 		 681 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  32.31 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2336  lipase, putative  30.59 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  31.45 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  30.41 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  27.41 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  31.97 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  30 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  30.11 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  29.38 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  40.18 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  29.44 
 
 		 413 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  30 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  26.9 
 
 		 681 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  30.72 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  28.87 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  30.56 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  34.04 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  30 
 
 		 413 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2388  lipase  25.14 
 
 		 643 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  31.62 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  33.33 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  32.31 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  30.65 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.66 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  34.29 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  26.55 
 
 		 547 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78871  predicted protein  52 
 
 		 114 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  32.99 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  29.57 
 
 		 276 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  27.12 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.39 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  27.5 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  32.33 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02710  lipase 2, putative  30.3 
 
 		 587 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  32.23 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  32.61 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  24.56 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  31.53 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 		 278 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>