More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3842 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 347 aa  695    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  70.78 
 
 		 349 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  67.35 
 
 		 343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  67.35 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  67.95 
 
 		 341 aa  461  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  65.41 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  66.86 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  64.52 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  63.43 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  65.8 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  65.62 
 
 		 350 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  66.57 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  65.99 
 
 		 348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  65.42 
 
 		 350 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  65.69 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  66.67 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  66.97 
 
 		 346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  63.98 
 
 		 348 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  68.31 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  63.58 
 
 		 349 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  62.18 
 
 		 350 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  62.82 
 
 		 350 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  64.04 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  67.53 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  70.85 
 
 		 340 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  63.34 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  65.65 
 
 		 346 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  62.65 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  65.99 
 
 		 346 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  66.28 
 
 		 346 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  66.95 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  66.95 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  63.14 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  62.84 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  63.48 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  57.93 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  59.7 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  57.88 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  58.03 
 
 		 364 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  57.97 
 
 		 336 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  58.02 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  53.38 
 
 		 356 aa  299  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  54.61 
 
 		 307 aa  298  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  51.71 
 
 		 305 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  52.33 
 
 		 305 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  51.71 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  53.45 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  51.2 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  48.59 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  45.08 
 
 		 305 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 		 308 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.61 
 
 		 302 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  38.19 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  38.19 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  36.65 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  36.65 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  36.3 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  36.3 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  36.3 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  36.3 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  36.3 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  35.74 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  36.88 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  34.84 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  36.43 
 
 		 294 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 291 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  31.58 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.57 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  38.21 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 262 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 311 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>