273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0137 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  100 
 
 		 425 aa  846    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  87.06 
 
 		 428 aa  709    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  56.34 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  50.12 
 
 		 410 aa  359  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  43.74 
 
 		 420 aa  289  6e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  40.49 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  39.41 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  39.95 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  40.25 
 
 		 418 aa  239  6.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  38.3 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  37.01 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  34.63 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  37.06 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  37.12 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  39.06 
 
 		 436 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  33.79 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  30.5 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  35.49 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  34.71 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  35.1 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  32.33 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  31.51 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  31.85 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  30.71 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  30.62 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  29.45 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  31.49 
 
 		 415 aa  113  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  27.36 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  24.02 
 
 		 589 aa  83.2  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.37 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  26.6 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  26.38 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  23.48 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  25.11 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.63 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.16 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.05 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  26.59 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  24.05 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  23.64 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  35.29 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.48 
 
 		 465 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  25.37 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.05 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.54 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  23.84 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  23.79 
 
 		 466 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  22.44 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  23.16 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  24.24 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  24.9 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  21.86 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.87 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  23.11 
 
 		 473 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  22.47 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  21.16 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  25.64 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  31.77 
 
 		 562 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  25.64 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  25.64 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  27 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.45 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  21.03 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  23.09 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  20.82 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  20.82 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  20.82 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  26.12 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  21.03 
 
 		 473 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  25.13 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  29.02 
 
 		 525 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.64 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  25.56 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  28.35 
 
 		 506 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  20.62 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  26.21 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  20.89 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 527 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  21.26 
 
 		 473 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  20.62 
 
 		 473 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  23.53 
 
 		 486 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  26.87 
 
 		 949 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  22.38 
 
 		 490 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  27.66 
 
 		 506 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  27.66 
 
 		 506 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  22.38 
 
 		 490 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  28.42 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  25.53 
 
 		 503 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  36.67 
 
 		 501 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  26.57 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  28.46 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  27.45 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  24.94 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  25.76 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  38.32 
 
 		 543 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>