267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0586 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 366 aa  741    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  78.13 
 
 		 359 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  61.88 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  61.31 
 
 		 354 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  60.96 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  58.71 
 
 		 358 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  59.42 
 
 		 365 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  59.58 
 
 		 350 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  60.18 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  61.88 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  61.68 
 
 		 349 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  59.88 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  59.59 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  60.52 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  61.29 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  57.31 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  56 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  60.12 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  60.7 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  54.07 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  54.93 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  60.12 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  63.77 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  59.88 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  54.33 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  56.37 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  52.75 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  52.68 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  56.5 
 
 		 348 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  66.03 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  56.5 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  56.47 
 
 		 365 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  55.98 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  57.85 
 
 		 352 aa  358  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  55.33 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  56.59 
 
 		 343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  56.38 
 
 		 334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  50.75 
 
 		 339 aa  349  5e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  52.54 
 
 		 350 aa  346  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  49.85 
 
 		 348 aa  345  8.999999999999999e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  49.57 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  48.94 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  50.29 
 
 		 353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  41.25 
 
 		 336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  41.25 
 
 		 336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  40.36 
 
 		 345 aa  245  8e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  34.04 
 
 		 319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  34.53 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.08 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  32.82 
 
 		 326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  31.44 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  37.1 
 
 		 319 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  29.72 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  35.8 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  34.85 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  34.7 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  34.47 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.98 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  34.87 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.18 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  31.89 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  32.21 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  32.33 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.68 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  31.23 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  29.33 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  29.33 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  31.92 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 328 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.47 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.98 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.36 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  31.22 
 
 		 321 aa  99.4  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.47 
 
 		 316 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.01 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  36.53 
 
 		 310 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  30.59 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.98 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  30.57 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.35 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 316 aa  96.3  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  30.32 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  30.17 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  31.67 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  26.22 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  30.19 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  31.98 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  30.56 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>