84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2452 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  30.57 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  32.47 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  32.47 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  32.47 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  32.45 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  31.25 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  31.13 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  32.12 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  30.46 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  31.97 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  28.93 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  31.97 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  28.48 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  29.53 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  29.03 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  32.45 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  31.97 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  29.14 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  31.85 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  26.45 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  31.58 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  31.37 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  28.06 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  31.13 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  32.95 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  30.72 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  35.23 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  30.82 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  30.68 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  30.66 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  27.22 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  33.33 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  28.41 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  31.03 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  30.86 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  24.38 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  22.52 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  28.41 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  28.41 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  28.41 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  28.41 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  28.41 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  28.41 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  28.41 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  27.89 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  34.62 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  37.68 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  47.4  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2975  hypothetical protein  27.21 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  27.21 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  32.29 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  27.97 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  30 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  26.37 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  26.14 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  27.56 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  27.56 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  27.56 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  20.25 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  20.13 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  28.68 
 
 		 316 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  29.73 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  25.17 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  28.12 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>