131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2092 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  100 
 
 		 727 aa  1462    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  44.72 
 
 		 743 aa  601  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  44.6 
 
 		 751 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  39.76 
 
 		 757 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  38.77 
 
 		 725 aa  485  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  39.53 
 
 		 712 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  42.44 
 
 		 678 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  37.03 
 
 		 734 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  32.63 
 
 		 884 aa  340  7e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  32.46 
 
 		 800 aa  338  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  35.94 
 
 		 772 aa  336  7e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  30.71 
 
 		 911 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72031  glutamated carboxypeptidase  24.5 
 
 		 847 aa  160  9e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80203  vacuolar targeting protein  24.11 
 
 		 896 aa  83.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397004  normal  0.0921162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  32 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  32.42 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  28.49 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  28.95 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  31.96 
 
 		 559 aa  64.7  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  27.63 
 
 		 552 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  39.53 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  36.56 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  27.13 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  27.8 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  30.32 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  24.65 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  39.02 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  36.08 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  30.24 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  24.69 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  31.3 
 
 		 458 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  25.12 
 
 		 557 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  31.85 
 
 		 467 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  36.61 
 
 		 544 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  32.37 
 
 		 514 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  31.15 
 
 		 481 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  24.43 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  24.36 
 
 		 487 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  29.52 
 
 		 495 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  24.65 
 
 		 557 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  23.7 
 
 		 472 aa  54.7  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  28.68 
 
 		 468 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  29.74 
 
 		 519 aa  54.7  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  30.83 
 
 		 468 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  30.83 
 
 		 468 aa  54.7  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  28.68 
 
 		 468 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  30.83 
 
 		 468 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  31.18 
 
 		 334 aa  54.3  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  34.69 
 
 		 472 aa  54.3  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  31.06 
 
 		 497 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  35.23 
 
 		 546 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  24.62 
 
 		 558 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  24.62 
 
 		 558 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  25.45 
 
 		 539 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  33.03 
 
 		 468 aa  53.9  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  27.27 
 
 		 518 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  24.34 
 
 		 545 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  28.57 
 
 		 526 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  25.33 
 
 		 522 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  33.33 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  36.56 
 
 		 471 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  30.83 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  29.35 
 
 		 515 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  31.09 
 
 		 477 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  33.63 
 
 		 509 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  30 
 
 		 468 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  40.24 
 
 		 460 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  31.36 
 
 		 468 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  33.66 
 
 		 947 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  24.03 
 
 		 552 aa  52  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  29.63 
 
 		 536 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  33.64 
 
 		 483 aa  51.6  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  37.36 
 
 		 312 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  34.65 
 
 		 417 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  29.63 
 
 		 535 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  30.92 
 
 		 500 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  24.6 
 
 		 556 aa  50.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  23.85 
 
 		 462 aa  50.8  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  30.23 
 
 		 414 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  27.63 
 
 		 555 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  41.38 
 
 		 524 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  33.86 
 
 		 417 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  32.43 
 
 		 501 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  31.93 
 
 		 466 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  31.03 
 
 		 503 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  37.11 
 
 		 513 aa  49.3  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  26.44 
 
 		 552 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  31.43 
 
 		 338 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  32.63 
 
 		 471 aa  49.3  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  32.38 
 
 		 578 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  25.18 
 
 		 563 aa  48.5  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  35.23 
 
 		 531 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  29.41 
 
 		 502 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  23 
 
 		 557 aa  48.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  37.36 
 
 		 563 aa  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  36.94 
 
 		 282 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  33.07 
 
 		 417 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  24.65 
 
 		 547 aa  47.8  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  33.07 
 
 		 417 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  32.26 
 
 		 579 aa  47.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>