More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0587 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 359 aa  700    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  47 
 
 		 325 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.74 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.44 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.97 
 
 		 365 aa  156  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.68 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  36.23 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  34.03 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.73 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  31.03 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  29.89 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  29.89 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  27.27 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  30.3 
 
 		 323 aa  103  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  30.3 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.61 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  30 
 
 		 323 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  31.86 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  29 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  31.55 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  27.22 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.97 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  28.04 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  29.16 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  30.16 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  27.41 
 
 		 329 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  26.8 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  26.63 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.46 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  30.15 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  28.44 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  29.71 
 
 		 364 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.29 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.64 
 
 		 345 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  29.84 
 
 		 320 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  30.16 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.16 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  29.84 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  30.16 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  30.16 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  29.51 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  29.87 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  29.68 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  29.43 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  28.86 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  36.64 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  30.6 
 
 		 320 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  30.6 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  30.28 
 
 		 320 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  27.36 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  30.75 
 
 		 352 aa  86.7  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  30.28 
 
 		 320 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  29.51 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  28.29 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  28.57 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.33 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.38 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  24.86 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.92 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.69 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.96 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  29.45 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  30.91 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.09 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.24 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.53 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  28.02 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.73 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  34.96 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.49 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  31.38 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.04 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.89 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.16 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.24 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  29.11 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.64 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  24.62 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  26.91 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  34.38 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  26.91 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.97 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  34.38 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  34.38 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.54 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.98 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.25 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  22.56 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.65 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2387  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  28.14 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.991592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.22 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1904  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.14 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  28.14 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.01 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  27.81 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  28.05 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06558  muconate cycloisomerase I  26.39 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.77 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  34.56 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>