More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0255 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  100 
 
 
182 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  40.22 
 
 
184 aa  134  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  40.45 
 
 
178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  43.26 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  43.26 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  36.52 
 
 
178 aa  125  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  40.54 
 
 
185 aa  125  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  42.86 
 
 
187 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  38.55 
 
 
179 aa  124  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  37.29 
 
 
178 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  36.67 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  40.62 
 
 
197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  35.2 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  35.03 
 
 
177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  38.38 
 
 
186 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  40.22 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  38.12 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  33.9 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  42.77 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  43.26 
 
 
189 aa  111  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  42.47 
 
 
191 aa  111  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  42.62 
 
 
187 aa  111  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6231  hypothetical protein  36.67 
 
 
183 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  37.7 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  40.22 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  43.21 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  33.89 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  40.54 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  39.79 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  50.39 
 
 
180 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  42.78 
 
 
180 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  45.7 
 
 
187 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  38.59 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  37.36 
 
 
189 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  36.9 
 
 
190 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  37.97 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  39.34 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  40.88 
 
 
189 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  48.78 
 
 
184 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  39.25 
 
 
185 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  33.9 
 
 
179 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  40.78 
 
 
198 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  41.36 
 
 
174 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  37.11 
 
 
194 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  32.43 
 
 
186 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  38.12 
 
 
187 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  41.83 
 
 
183 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  44.72 
 
 
208 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  44.72 
 
 
208 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  39.46 
 
 
186 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  33.87 
 
 
186 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  38.67 
 
 
184 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  38.8 
 
 
185 aa  104  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  39.68 
 
 
185 aa  104  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  42.68 
 
 
187 aa  104  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  39.02 
 
 
184 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  38.12 
 
 
187 aa  104  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  37.77 
 
 
193 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  50 
 
 
175 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.43 
 
 
194 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  38.64 
 
 
180 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  40.11 
 
 
186 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  40.56 
 
 
188 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  50 
 
 
175 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  43.17 
 
 
184 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  43.42 
 
 
192 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  39.56 
 
 
184 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  38.27 
 
 
174 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  44.53 
 
 
186 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  38.71 
 
 
187 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  34.95 
 
 
207 aa  101  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  42.14 
 
 
177 aa  101  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  34.24 
 
 
183 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  49.6 
 
 
188 aa  100  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  39.88 
 
 
184 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  35.52 
 
 
185 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  43.24 
 
 
186 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  38.92 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  31.87 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  29.78 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  35.33 
 
 
211 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  34.97 
 
 
185 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  37.97 
 
 
187 aa  99  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  30.98 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  39.04 
 
 
185 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  44.44 
 
 
184 aa  99  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  34.24 
 
 
188 aa  99  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  41.58 
 
 
198 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  33.88 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  33.88 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  33.7 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  33.88 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  33.88 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  33.88 
 
 
188 aa  98.2  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  38.55 
 
 
179 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  39.68 
 
 
185 aa  98.2  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  37.5 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  41.24 
 
 
189 aa  98.2  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  38.55 
 
 
179 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>