More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6373 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  524  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  92.91 
 
 		 254 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  82.19 
 
 		 255 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  73.86 
 
 		 244 aa  367  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  68.05 
 
 		 245 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  69.58 
 
 		 244 aa  352  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  68.85 
 
 		 249 aa  351  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  69.29 
 
 		 249 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6371  ABC transporter related  72.2 
 
 		 256 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  67.62 
 
 		 249 aa  345  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  67.62 
 
 		 249 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  65.98 
 
 		 247 aa  339  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  65.29 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.83 
 
 		 242 aa  325  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.4 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.83 
 
 		 242 aa  309  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  62.5 
 
 		 242 aa  309  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60 
 
 		 246 aa  305  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  59.5 
 
 		 268 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.2 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  60.34 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  57.61 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  60.42 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3478  ABC transporter related  62.24 
 
 		 242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.47 
 
 		 255 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58 
 
 		 252 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  58.65 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.66 
 
 		 242 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  58 
 
 		 249 aa  299  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.28 
 
 		 259 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  59.17 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 262 aa  298  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  59.75 
 
 		 243 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.18 
 
 		 244 aa  297  8e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  57.31 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  57.31 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.92 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  58.68 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.82 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  59.09 
 
 		 242 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  59.17 
 
 		 242 aa  295  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  59.5 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 		 269 aa  295  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 242 aa  294  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  59.09 
 
 		 273 aa  295  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  60.33 
 
 		 244 aa  294  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  59.09 
 
 		 241 aa  294  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.57 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  61.16 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.25 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 251 aa  294  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  56.67 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  59.26 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  59.02 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  57.38 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  58.17 
 
 		 270 aa  292  3e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  58.92 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  57.85 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  58.92 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  56.8 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  60.42 
 
 		 261 aa  291  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  57.02 
 
 		 250 aa  291  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.92 
 
 		 251 aa  291  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  55.16 
 
 		 257 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  57.5 
 
 		 246 aa  291  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  60.42 
 
 		 259 aa  291  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  60.94 
 
 		 247 aa  291  8e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  58.33 
 
 		 245 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  58.2 
 
 		 246 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.08 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  58.68 
 
 		 241 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  58.68 
 
 		 241 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  61.34 
 
 		 257 aa  291  9e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  55.95 
 
 		 269 aa  291  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  58.51 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  57.55 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  59.52 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  57.87 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  61.25 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  57.92 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  55.16 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  60.5 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  57.92 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  59.92 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  59.52 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.5 
 
 		 249 aa  289  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  61.67 
 
 		 250 aa  289  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  58.68 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  55.79 
 
 		 258 aa  288  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  56.25 
 
 		 256 aa  289  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  55.79 
 
 		 258 aa  288  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  57.08 
 
 		 258 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  57.92 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.97 
 
 		 263 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  61.25 
 
 		 248 aa  288  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  56.97 
 
 		 250 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 		 251 aa  288  8e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>