More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6011 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  100 
 
 		 336 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  45.52 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  46.92 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.8 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  41.35 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  42.29 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  38.68 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  39.64 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  39.57 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 331 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  39.93 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  41.91 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  39.56 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  39.61 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  42.5 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  42.45 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  42.63 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  33.67 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  38.31 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  40.14 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.77 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  33 
 
 		 335 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  33 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  33 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.77 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  33.57 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.72 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  32.55 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  32.55 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  32.55 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  32.29 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.28 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.92 
 
 		 310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  31.53 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  29.97 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  31.53 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 		 835 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.39 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4552  D-allose transporter subunit  36.5 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03958  D-allose transporter subunit  36.5 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3905  Monosaccharide-transporting ATPase  36.5 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03918  hypothetical protein  36.5 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3940  D-allose transporter subunit  36.5 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  31.4 
 
 		 328 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  33.11 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  31.27 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  31.27 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  31.27 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  31.27 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  31.27 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  31.27 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  31.27 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  32.77 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  31.56 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  31.14 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.63 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  34.92 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  32.04 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.53 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  31.82 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2474  L-arabinose transporter permease protein  30.97 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.552924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  34.72 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  32.45 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  34.6 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0548  L-arabinose transporter permease protein  31.09 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0318738  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  31.31 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3409  L-arabinose transporter permease protein  31.41 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0925142  normal  0.0828764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  32.64 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.73 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  32.29 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  32.29 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  32.01 
 
 		 360 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  32.64 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  32.67 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>