134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2567 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
258 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  89.88 
 
 
258 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.44 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.21 
 
 
266 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  41.61 
 
 
238 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.1 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.65 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.73 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.5 
 
 
233 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.96 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.31 
 
 
237 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.62 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  34.35 
 
 
252 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.22 
 
 
288 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  35.94 
 
 
252 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.28 
 
 
244 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.61 
 
 
281 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.5 
 
 
282 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.72 
 
 
234 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.54 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.82 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.51 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  28.57 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.57 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  95.5  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  30.43 
 
 
377 aa  94  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.71 
 
 
237 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.69 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  28.64 
 
 
343 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.88 
 
 
250 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 
383 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  25.65 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  32.06 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.82 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.04 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  23.46 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  31.82 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.78 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  28.27 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.08 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.58 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.06 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  25 
 
 
327 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.14 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  31.94 
 
 
190 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.77 
 
 
271 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.49 
 
 
301 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1895  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.3 
 
 
176 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.949343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  26.19 
 
 
283 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.95 
 
 
312 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.11 
 
 
313 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.39 
 
 
216 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  26.26 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.44 
 
 
312 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  39.33 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  28.57 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  27.64 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.82 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.2 
 
 
311 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.23 
 
 
193 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  29.1 
 
 
287 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.22 
 
 
300 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.35 
 
 
228 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.99 
 
 
190 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.75 
 
 
331 aa  52  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.41 
 
 
268 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0368  dioxygenase family protein  26.89 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  26.38 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.59 
 
 
325 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.94 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0643  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.83 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.599844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  25.77 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  23.16 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  23.53 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.82 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2326  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  27.4 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.35 
 
 
343 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  29.45 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  30.15 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  30.15 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.27 
 
 
288 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  27.49 
 
 
293 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  30.15 
 
 
287 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.19 
 
 
290 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  25 
 
 
297 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  24.26 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  25.6 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  26.63 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  25.35 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  24.24 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0053  dioxygenase, putative  25.17 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  28.89 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  26.98 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  25.14 
 
 
309 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1581  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  26.74 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  29.41 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.15 
 
 
328 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  25.77 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>