More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0317 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0317  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  246  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0286  response regulator receiver protein  84.8 
 
 		 125 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.85 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.85 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4356  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.93 
 
 		 248 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509549  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4201  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  30 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4333  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.93 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  32.94 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  32.94 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  29.75 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 		 1431 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 1385 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.02 
 
 		 379 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 806 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  36.46 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 989 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  36.25 
 
 		 955 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  48.28 
 
 		 764 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4953  response regulator receiver protein  26.5 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 1361 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  50 
 
 		 789 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  50 
 
 		 793 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 811 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 755 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 767 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 989 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 762 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1631 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 1370 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  28.33 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  25.47 
 
 		 1327 aa  52  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.03 
 
 		 635 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  48.28 
 
 		 764 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 383 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2781  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 1299 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  48.28 
 
 		 769 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 765 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  31.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  34.85 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.03 
 
 		 635 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 231 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  28.43 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4350  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  44.29 
 
 		 248 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767241  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  44.12 
 
 		 652 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.23 
 
 		 230 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  26.27 
 
 		 1137 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 230 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  28.95 
 
 		 1373 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.23 
 
 		 230 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 		 1137 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  48.28 
 
 		 752 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  30.4 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 1391 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.2 
 
 		 326 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  34.29 
 
 		 245 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 119 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  32.98 
 
 		 246 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35.16 
 
 		 265 aa  50.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 1651 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>