More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0140 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 135 aa  277  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  88.43 
 
 		 121 aa  221  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  61.22 
 
 		 103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  59.79 
 
 		 116 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  56.06 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  53.85 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 		 99 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  50.85 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  39.02 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  42.03 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44.26 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  39.06 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  47.46 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  39.06 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  29.11 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  41.54 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  37.88 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  37.88 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  37.88 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  37.5 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>