More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4871 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  36.82 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  38.21 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  38.21 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  36.4 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  26.48 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  28.82 
 
 		 311 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.73 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.94 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.18 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.27 
 
 		 329 aa  68.6  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.64 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  23.86 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.52 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  32 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  40.96 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  41.57 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.35 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  29.38 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.23 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.23 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  29.55 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  28.4 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.39 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  28.81 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  27.14 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  27.35 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  37.63 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  24.74 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.53 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  24.74 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.53 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.53 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.53 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.53 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  25.17 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.22 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 		 350 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  30.72 
 
 		 500 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  25.17 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 317 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  25.17 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  41.57 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  26.35 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.19 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 		 497 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 321 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 317 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>