288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3175 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  79.35 
 
 		 184 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  46.11 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.72 
 
 		 189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  42.46 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  42.46 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  41.9 
 
 		 183 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  39.27 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  46.56 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  41.21 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  40.66 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.17 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 		 196 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  37.08 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 201 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.51 
 
 		 378 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.46 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.56 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 370 aa  70.9  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.52 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.52 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 412 aa  68.2  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  28.67 
 
 		 401 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.99 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 411 aa  65.5  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  34.27 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 226 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 212 aa  60.8  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  31.18 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.25 
 
 		 442 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  28.75 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  31.89 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29.38 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  30.66 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.78 
 
 		 442 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.61 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.4 
 
 		 547 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  26.58 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 449 aa  54.7  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  33.33 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  22.55 
 
 		 442 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  29.83 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  33.77 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  35.34 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 459 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  26.74 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  22.99 
 
 		 442 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.76 
 
 		 442 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>