More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2903 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  100 
 
 
274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  92.34 
 
 
274 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  65.2 
 
 
274 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  60.89 
 
 
272 aa  350  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  56.36 
 
 
278 aa  322  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  55.13 
 
 
265 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  51.15 
 
 
265 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  50 
 
 
270 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  50 
 
 
273 aa  275  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  50.57 
 
 
266 aa  259  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  48.26 
 
 
267 aa  255  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  44.2 
 
 
275 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  44.09 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  44.2 
 
 
274 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  41.95 
 
 
286 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  41.95 
 
 
296 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  42.75 
 
 
274 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  43.96 
 
 
273 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  36.71 
 
 
318 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  36.71 
 
 
318 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  36.71 
 
 
318 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  36.71 
 
 
318 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  36.71 
 
 
318 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  36.71 
 
 
318 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  36.71 
 
 
318 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  42.7 
 
 
282 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  39.57 
 
 
287 aa  198  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  36.79 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  43.14 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  43.4 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  43.14 
 
 
269 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  41.54 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  42.23 
 
 
268 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  39.23 
 
 
282 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  37.97 
 
 
275 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  38.66 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  33.44 
 
 
329 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  38.97 
 
 
263 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  40.1 
 
 
334 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  37.08 
 
 
265 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  38.55 
 
 
265 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  40.1 
 
 
338 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  37.81 
 
 
276 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  38.02 
 
 
266 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  39.13 
 
 
273 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  37.94 
 
 
273 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  38.06 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  37.46 
 
 
276 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  37.64 
 
 
266 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  38.78 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  37.26 
 
 
269 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  36.47 
 
 
264 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  37.78 
 
 
266 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  39.9 
 
 
335 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  39.9 
 
 
335 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  39.9 
 
 
335 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  42.57 
 
 
331 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.62 
 
 
316 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  32.62 
 
 
311 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  36.6 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  36.6 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.79 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  35.98 
 
 
259 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  37.46 
 
 
292 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  35.4 
 
 
272 aa  142  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  36.74 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  32.87 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.32 
 
 
318 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  33.81 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  36.69 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  31.8 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  32.38 
 
 
273 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  32.73 
 
 
291 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 
281 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  32.34 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  31.07 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  33.68 
 
 
293 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  34.18 
 
 
272 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  31.97 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.99 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  30.82 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  31.07 
 
 
308 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  32.39 
 
 
293 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  29.63 
 
 
316 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  34.42 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  31.32 
 
 
654 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.5 
 
 
280 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  29.15 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  28.42 
 
 
293 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  29.45 
 
 
292 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  29.31 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  30.16 
 
 
352 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2469  transglutaminase domain-containing protein  29.89 
 
 
313 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.451679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  31.72 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  31.72 
 
 
367 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  31.72 
 
 
361 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  29.59 
 
 
319 aa  112  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  29.9 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  29.51 
 
 
344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>