More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2266 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
237 aa  470  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  86.92 
 
 
237 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  59.07 
 
 
232 aa  261  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  53.36 
 
 
235 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  46.86 
 
 
202 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  46.86 
 
 
202 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  41.04 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  46.29 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  46.59 
 
 
203 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  37.28 
 
 
195 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  44.57 
 
 
203 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  38.08 
 
 
233 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  45.64 
 
 
209 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  36.16 
 
 
267 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  41.67 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  47.88 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  44.51 
 
 
215 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  44.2 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  41.46 
 
 
222 aa  98.6  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  32.93 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  34.31 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  32.75 
 
 
180 aa  91.7  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  31.74 
 
 
202 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  35.84 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  34.36 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  27.01 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  30.3 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  29.83 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  29.28 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 
283 aa  72  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  30.51 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  32.04 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  28.93 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  29.51 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.32 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  29.89 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  31.11 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  31.11 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  31.11 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.94 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  29.08 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  30.16 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  30.94 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  27.27 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  28.5 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  31.11 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  32.28 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  28.28 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  30.99 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  30.23 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  29.67 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  29.15 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  32.26 
 
 
205 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  28.89 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  28.76 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  29.73 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  28.87 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  28.14 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
203 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
203 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  29.12 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  26.67 
 
 
198 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  29.45 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  28.68 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  29.12 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  32.03 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  29.65 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  30.16 
 
 
180 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  32.59 
 
 
293 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  26.7 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  31.25 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  30.95 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  33.07 
 
 
292 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  29.07 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  33.07 
 
 
439 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  28.77 
 
 
292 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  27.94 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  31.34 
 
 
827 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  27 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  34.36 
 
 
319 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 
292 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  32.2 
 
 
285 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  33.85 
 
 
206 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  33.71 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  28.78 
 
 
217 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  29.37 
 
 
277 aa  58.5  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  31.39 
 
 
288 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  28.15 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  24.86 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  26.06 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  26.7 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  30.16 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  30.16 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  30.15 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  26.87 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  30.99 
 
 
291 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  26.52 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  27.92 
 
 
832 aa  55.8  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>