More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0785 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 251 aa  500  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  95.22 
 
 		 251 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  63.64 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  51.21 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  53.88 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  50.85 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  51.32 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  49.79 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  47.18 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  44.05 
 
 		 252 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  40.89 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  36.82 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  35.08 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  39.89 
 
 		 253 aa  148  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  38.02 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  34.06 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  37.77 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  38.24 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  32.23 
 
 		 248 aa  138  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  30.99 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 274 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  31.82 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  38.08 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  33.04 
 
 		 249 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  34.16 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  36.36 
 
 		 260 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  30.04 
 
 		 247 aa  128  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 315 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 376 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 270 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  31.3 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  34.55 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  30.12 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  30.12 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  31.78 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.46 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  30.61 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  37.68 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  30.45 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.74 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.92 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  34.04 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  33.91 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  32.5 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.09 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  31.2 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.17 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.06 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  29.34 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>