139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1830 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  71.17 
 
 		 283 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  70 
 
 		 289 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  68.25 
 
 		 271 aa  374  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  68.25 
 
 		 271 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  69.92 
 
 		 269 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  63.06 
 
 		 286 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  63.53 
 
 		 275 aa  344  7e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  53.33 
 
 		 280 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  47.96 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  47.96 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  48.33 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  47.41 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  47.58 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  49.03 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  47.58 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  47.94 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  49.03 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  47.94 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  47.78 
 
 		 309 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  48.12 
 
 		 267 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  48.65 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  48.65 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  48.65 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  48.65 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  44.81 
 
 		 273 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  46.84 
 
 		 267 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  43.33 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  43.01 
 
 		 273 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  47.94 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  45 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  33.84 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  36.26 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  32.57 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  32.57 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  35.23 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 268 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  33.85 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  33.72 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 267 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  32.57 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  32.57 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  31.8 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  32.05 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  30 
 
 		 296 aa  118  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  30.69 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  32.22 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  23.7 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  28.87 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  24.63 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  21.93 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  23.7 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  24.91 
 
 		 320 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  37.66 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  31.13 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  37.31 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  35.8 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  38.82 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.3 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  40.24 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>