More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6262 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  540  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  51 
 
 		 268 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 263 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  50.19 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  49.03 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  49.81 
 
 		 261 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  34.63 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3645  IclR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6477  regulatory protein, IclR  34.38 
 
 		 351 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  33.73 
 
 		 287 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  33.6 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  33.89 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33.89 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 275 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1546  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00070993  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 261 aa  148  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0318  regulatory proteins, IclR  29.84 
 
 		 287 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000583044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33.64 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  32.22 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  32.22 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  32.33 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  29.75 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  30.16 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  29.34 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 267 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.8 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.8 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  31.56 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.38 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.38 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 		 549 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 601 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.63 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.49 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  32.87 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  31.8 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  29.6 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1344  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 262 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.491684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  32.51 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.49 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>