281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3634 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  68.57 
 
 		 222 aa  278  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  63.1 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  58.21 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  51.6 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  47.24 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  46.77 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  51.11 
 
 		 203 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  44.83 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  50.56 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  50.56 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  44.51 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  43.65 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  43.65 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  48.62 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  38.5 
 
 		 267 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  43.93 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  32.16 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  39.88 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  33.89 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 		 196 aa  84.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  31.43 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  32.02 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  28.98 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  32.08 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  31.41 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  29.08 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3989  cytochrome c oxidase, subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3702  cytochrome c oxidase, subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4060  cytochrome c oxidase, subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4044  cytochrome c oxidase, subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3768  cytochrome c oxidase subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1195  cytochrome c oxidase, subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3854  cytochrome c oxidase subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3685  cytochrome c oxidase, subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3957  cytochrome c oxidase, subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4152  cytochrome c oxidase subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.951057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2644  cytochrome c oxidase subunit III  26.73 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.252638  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  31.12 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  32.3 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.56 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.92 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  33.73 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  34.27 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  31.82 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  28.4 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1143  cytochrome c oxidase, subunit III  28.92 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537108  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  32.04 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  31.75 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  32.34 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.59 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  26.02 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  32.32 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  30 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  26.52 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  32.72 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  33.86 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  26.9 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  32.72 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  32.72 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  29.38 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  27.4 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  30.95 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  30.15 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  31.36 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4374  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.25 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  29.83 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  26.47 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  29.95 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.88 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  32.32 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  28.81 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  27.83 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  37.11 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  32.12 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0814  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.12 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.692296  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0837  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.12 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900518  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0851  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.12 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1088  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  25.67 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000882712  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4577  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  25 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  27.27 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  37.36 
 
 		 743 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  29.68 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  30.23 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  26.92 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  26.67 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.5 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  28.64 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  26.87 
 
 		 832 aa  52  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.5 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  28.14 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  28.42 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3100  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  25.67 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  27.57 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>