More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2533 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
394 aa  799    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  78.26 
 
 
287 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
277 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
283 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 
283 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  30.51 
 
 
286 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
284 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
307 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 
267 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  30.97 
 
 
285 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
283 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
283 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
283 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
260 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1055  alpha/beta hydrolase  35.64 
 
 
239 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  30.22 
 
 
279 aa  93.2  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  33.21 
 
 
287 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
268 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
265 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  33.58 
 
 
283 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
273 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.2 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  24.54 
 
 
275 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
282 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.47 
 
 
282 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.03 
 
 
296 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
283 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.68 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  25.68 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  25.34 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.79 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.29 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25.99 
 
 
277 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  37.17 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
268 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  28.42 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  26.15 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  27.94 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.07 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
267 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  27.8 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  32.58 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  30.25 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.3 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  29.09 
 
 
277 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  20.88 
 
 
270 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  24.73 
 
 
261 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  40.59 
 
 
275 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
293 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.73 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  20.8 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.41 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2516  hydrolase, alpha/beta fold family  26.54 
 
 
242 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
270 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  20.8 
 
 
270 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
272 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  27.99 
 
 
261 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.94 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.14 
 
 
263 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
275 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
277 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
278 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  21.48 
 
 
270 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  21.48 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
277 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 
262 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  34.11 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
278 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 
265 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
226 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
274 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
278 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
277 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
275 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  34.19 
 
 
219 aa  63.5  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>