More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0247 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 407 aa  813    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  77.15 
 
 		 407 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 440 aa  189  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.732563  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1935  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3835  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  38 
 
 		 853 aa  179  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 437 aa  173  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.58 
 
 		 952 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 844 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 801 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 804 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 842 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  35.57 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 852 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  34.55 
 
 		 852 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  36.67 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 655 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 552 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  37.39 
 
 		 1379 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 557 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 431 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 470 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 1048 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  36.29 
 
 		 1092 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.8 
 
 		 1255 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  35.06 
 
 		 1258 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 552 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  27.14 
 
 		 391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 645 aa  156  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1262 aa  156  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 655 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1047 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 544 aa  156  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  36.18 
 
 		 1062 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 395 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 589 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 589 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 646 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 589 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 588 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.26 
 
 		 1258 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 589 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 652 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  27.54 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 557 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  34.77 
 
 		 912 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 656 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 552 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  32.88 
 
 		 656 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  37.11 
 
 		 887 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  35.92 
 
 		 542 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1047 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.4 
 
 		 819 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  35.1 
 
 		 1061 aa  149  8e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 737 aa  149  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  37.2 
 
 		 812 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 516 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 663 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 695 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5110  histidine kinase  30.09 
 
 		 558 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  0.0814675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2474  histidine kinase  27.86 
 
 		 559 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.369133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  36 
 
 		 556 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 688 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 583 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 552 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 592 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  35.74 
 
 		 592 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 793 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0701  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 545 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.310619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1631 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 853 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 819 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 548 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 570 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 762 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 557 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2828  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 584 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1180 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1126 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5603  hypothetical protein  33.22 
 
 		 756 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 827 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 953 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  36.4 
 
 		 647 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  37.32 
 
 		 600 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>