285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1878 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  99.08 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  89.91 
 
 		 218 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  72.77 
 
 		 220 aa  316  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  69.48 
 
 		 246 aa  309  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  69.95 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  69.48 
 
 		 267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  67.61 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  63.38 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  69.95 
 
 		 216 aa  294  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  72.3 
 
 		 218 aa  293  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  67.44 
 
 		 244 aa  291  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  66.2 
 
 		 262 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  67.14 
 
 		 236 aa  285  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  64.32 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  63.59 
 
 		 239 aa  280  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  65.73 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  65.73 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  67.91 
 
 		 225 aa  277  7e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  61.97 
 
 		 216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  62.86 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  62.96 
 
 		 225 aa  267  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  65.74 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  66.05 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  65.12 
 
 		 241 aa  262  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  67.14 
 
 		 235 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  63.38 
 
 		 244 aa  260  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  67.13 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  63.38 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  67.96 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  60.45 
 
 		 228 aa  250  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  65.28 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  62.33 
 
 		 226 aa  248  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  62.33 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  64.06 
 
 		 240 aa  245  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  58.96 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  61.4 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  55 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  63.27 
 
 		 222 aa  231  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  43.98 
 
 		 214 aa  211  7e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  44.13 
 
 		 205 aa  210  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  43.98 
 
 		 214 aa  204  8e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.89 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  39.11 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  39.11 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  40.29 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  40.78 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  42.41 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  38.61 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  41 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  42.25 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.24 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  39.6 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  38.35 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  39.32 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  38.31 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  38.29 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  38.83 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  40.22 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  33.01 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  41.24 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  33.01 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  36.28 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  38.35 
 
 		 215 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  36.28 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  38.35 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  38.35 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  38.35 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  33.96 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  37.98 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  42.65 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  38.61 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  39.46 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  42.71 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  38.73 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1967  lipoate-protein ligase B  39.52 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  41.04 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  41.04 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>