More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05454 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 256 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  81.97 
 
 		 245 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  80.49 
 
 		 259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  80.41 
 
 		 245 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  80.41 
 
 		 245 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  78.37 
 
 		 245 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  75.41 
 
 		 262 aa  349  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.33 
 
 		 245 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  68.94 
 
 		 244 aa  334  7.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  73.16 
 
 		 342 aa  331  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  73.01 
 
 		 242 aa  327  9e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  67.19 
 
 		 250 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.44 
 
 		 238 aa  308  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  65.37 
 
 		 228 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  66.95 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.66 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.11 
 
 		 228 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  55.17 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  55.17 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  55.17 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  56.44 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  56.83 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.91 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.42 
 
 		 222 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  52.72 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  50.44 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.23 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  57.42 
 
 		 154 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  45.33 
 
 		 227 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 231 aa  168  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 237 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 232 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  39.57 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 229 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  42.37 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 226 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 227 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.81 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 229 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.25 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 231 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.87 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  37.17 
 
 		 227 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.06 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 242 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  41.1 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  41.1 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.14 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>