154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03929 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  94.41 
 
 		 590 aa  1105    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  100 
 
 		 590 aa  1207    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  66.04 
 
 		 595 aa  759    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  66.73 
 
 		 585 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  64.27 
 
 		 586 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  66.32 
 
 		 578 aa  807    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  68.05 
 
 		 584 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  65.6 
 
 		 584 aa  719    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  70.17 
 
 		 588 aa  858    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  68.24 
 
 		 586 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  62.54 
 
 		 593 aa  742    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  66.92 
 
 		 585 aa  760    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  67.11 
 
 		 568 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  69.17 
 
 		 561 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  63.64 
 
 		 586 aa  743    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  64.94 
 
 		 594 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  68.81 
 
 		 584 aa  781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  42.05 
 
 		 578 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  42.03 
 
 		 563 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  67.54 
 
 		 294 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  40.4 
 
 		 582 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  37.54 
 
 		 580 aa  362  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  40.04 
 
 		 574 aa  360  4e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.86 
 
 		 581 aa  359  7e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  40.14 
 
 		 581 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.92 
 
 		 592 aa  353  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  36.93 
 
 		 562 aa  353  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.93 
 
 		 562 aa  353  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  37.24 
 
 		 562 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.24 
 
 		 562 aa  350  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  37.24 
 
 		 562 aa  349  7e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  38.98 
 
 		 570 aa  347  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  36.58 
 
 		 572 aa  336  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.58 
 
 		 581 aa  335  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  36.36 
 
 		 564 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.44 
 
 		 563 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  37.87 
 
 		 585 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  33.33 
 
 		 574 aa  279  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.45 
 
 		 568 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  30.81 
 
 		 550 aa  250  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.75 
 
 		 570 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  31.35 
 
 		 556 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.96 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  28.95 
 
 		 566 aa  231  4e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  29.53 
 
 		 590 aa  230  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  28.92 
 
 		 590 aa  226  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.29 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  31.4 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  31.74 
 
 		 565 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.48 
 
 		 593 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  31.07 
 
 		 562 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  31.07 
 
 		 562 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.39 
 
 		 549 aa  211  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  30.43 
 
 		 569 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.3 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.5 
 
 		 566 aa  203  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.14 
 
 		 558 aa  200  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  29.61 
 
 		 570 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.99 
 
 		 585 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  27.43 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.7 
 
 		 554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.6 
 
 		 573 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.98 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0153  outer membrane hemolysin activator protein  68.7 
 
 		 118 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.54 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  67.8 
 
 		 121 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.44 
 
 		 610 aa  161  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  27.85 
 
 		 582 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  24.62 
 
 		 562 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  26.73 
 
 		 575 aa  157  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.28 
 
 		 591 aa  153  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.72 
 
 		 591 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.81 
 
 		 580 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.5 
 
 		 565 aa  146  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.53 
 
 		 591 aa  146  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.32 
 
 		 608 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.16 
 
 		 592 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.34 
 
 		 597 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  26.98 
 
 		 602 aa  144  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1986  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  59.09 
 
 		 166 aa  143  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  25.56 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  25.56 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  25.56 
 
 		 558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  25.56 
 
 		 558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  25.34 
 
 		 554 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  26.83 
 
 		 570 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  25.64 
 
 		 554 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  27.41 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  27.32 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.61 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.14 
 
 		 558 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.63 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.63 
 
 		 553 aa  123  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.61 
 
 		 559 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.35 
 
 		 553 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.75 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  24.75 
 
 		 583 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  24.43 
 
 		 583 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  37.79 
 
 		 354 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  23.31 
 
 		 547 aa  103  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>