More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0778 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  93.78 
 
 		 241 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  62.61 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  60.67 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.67 
 
 		 254 aa  291  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  60.68 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  59.41 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  62.13 
 
 		 253 aa  288  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  58.4 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  60.92 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  61.6 
 
 		 248 aa  285  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.26 
 
 		 251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  58.85 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  58.68 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  58.58 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  57.85 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  57.85 
 
 		 252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  59.07 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  57.85 
 
 		 251 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  57.85 
 
 		 251 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  59 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  60.34 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  61.47 
 
 		 231 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  60.68 
 
 		 239 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  57.44 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  57.32 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  57.32 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  61.86 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  56.3 
 
 		 249 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.9 
 
 		 251 aa  274  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  59.75 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.9 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  58.33 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  56.12 
 
 		 248 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  57.14 
 
 		 252 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  56.84 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  56.2 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  58.75 
 
 		 251 aa  257  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.56 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  56.25 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  55.88 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  54.24 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  53.19 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.63 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  49.57 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  48.07 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.79 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  49.79 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  47.46 
 
 		 239 aa  228  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.15 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 236 aa  227  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  48.95 
 
 		 237 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  50.89 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  46.35 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 247 aa  225  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  50 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  48.31 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  48.31 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  48.31 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  50.84 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  49.15 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  50.84 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  51.07 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  52.36 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  50.63 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  45.89 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.25 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  48.07 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  47.88 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  49.79 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  50.62 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  47.48 
 
 		 256 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  47.9 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  49.79 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  49.57 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  48.55 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>