165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0512 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  73.44 
 
 		 237 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  63.75 
 
 		 232 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  59.36 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  64.18 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  60.89 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  55.14 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  36.69 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  38.03 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  39.33 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  37.1 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  41.71 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  37.92 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  34.75 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  37.27 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  37.14 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  35.29 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  41.23 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  38.73 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  38.46 
 
 		 250 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  38.46 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  36.1 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  36.87 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  35.86 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  38.16 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  37.38 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  35.87 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  32 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  32.41 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  32.7 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  29.17 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  35.47 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  33.49 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  35.47 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  35.44 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  35.02 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  31.8 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  33.49 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  27.59 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  34.95 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  27.59 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  32.84 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  33.82 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  33.89 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  32.54 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  30.58 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  33.8 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  35.44 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  35.8 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  30.99 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  37.13 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  30.39 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  28.99 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  28.99 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  28.99 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  29.51 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  32.2 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  29.41 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  33.98 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  34.32 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  30.87 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  34.32 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  31.28 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  31.58 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  30.72 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  33.67 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  26.17 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  29.79 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  35.44 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  27.02 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  35.05 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  30.46 
 
 		 236 aa  72  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  31.41 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  31.25 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  32.2 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  28.43 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  25.64 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  28.95 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  30.89 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  26.11 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  31.82 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  27.54 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  25.71 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  28.99 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  32.32 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  33.99 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  32.62 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  30.72 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  26.42 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>