More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4330 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  70.81 
 
 		 444 aa  662    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  68.47 
 
 		 446 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  82.35 
 
 		 442 aa  782    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  70.59 
 
 		 444 aa  661    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  87.1 
 
 		 444 aa  772    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  100 
 
 		 444 aa  910    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  88.46 
 
 		 444 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  83.26 
 
 		 464 aa  780    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  87.1 
 
 		 444 aa  803    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  71.49 
 
 		 446 aa  661    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  70.43 
 
 		 442 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  70.05 
 
 		 446 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  68.55 
 
 		 444 aa  653    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  71.62 
 
 		 446 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  82.13 
 
 		 444 aa  765    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  70.59 
 
 		 445 aa  648    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  67.87 
 
 		 441 aa  650    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  69.25 
 
 		 440 aa  632  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  69.91 
 
 		 445 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  65.84 
 
 		 445 aa  621  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  61.54 
 
 		 445 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  62.9 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  60.59 
 
 		 453 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  58.76 
 
 		 441 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  59.59 
 
 		 465 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  58.81 
 
 		 456 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  58.81 
 
 		 456 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  59.27 
 
 		 458 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  58.58 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  51.03 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  50 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  50.57 
 
 		 439 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  43.44 
 
 		 437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  43.21 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  42.43 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  42.01 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  42.43 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  40.99 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  39.91 
 
 		 440 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  40.54 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  39.14 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  38.84 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  38.55 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  36.59 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  36.79 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  38.82 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  35.7 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  34.32 
 
 		 444 aa  269  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  33.71 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  36.15 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  36.59 
 
 		 449 aa  266  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  36.05 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  38.41 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  35.67 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  36.07 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  35.7 
 
 		 449 aa  256  6e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  36.51 
 
 		 445 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  35.48 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  36.26 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  33.41 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  32.55 
 
 		 444 aa  240  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.07 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  34.99 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  33.63 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  34.81 
 
 		 468 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.43 
 
 		 494 aa  229  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  33.81 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  32.28 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  34.37 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  37.39 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.39 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  38.37 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  34.3 
 
 		 449 aa  217  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  35.27 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  35.51 
 
 		 448 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.66 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.08 
 
 		 420 aa  207  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  36.9 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  31.07 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  34.17 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.52 
 
 		 426 aa  200  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.45 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  32.41 
 
 		 426 aa  199  7e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  32.49 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  32.72 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  32.27 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  32.27 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  32.27 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  31.58 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.7 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  32.27 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  32.27 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.31 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  33.02 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  31.95 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  32.27 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.38 
 
 		 431 aa  194  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  32.27 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>